[发明专利]扩增TCR α链和/或β链的引物组合及其应用在审
申请号: | 202310037324.1 | 申请日: | 2023-01-10 |
公开(公告)号: | CN115948389A | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 谢兴旺;蒋栋;翟佳慧;薛江芝;李雅真 | 申请(专利权)人: | 北京可瑞生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6848 |
代理公司: | 北京华进京联知识产权代理有限公司 11606 | 代理人: | 王永莉 |
地址: | 102200 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 扩增 tcr 引物 组合 及其 应用 | ||
1.一种引物组合,其特征在于,所述引物组合包括逆转录引物组,所述逆转录引物组包括逆转录正向引物和逆转录反向引物;其中,所述逆转录正向引物包括5’-第一Read1序列-TTTCTTATTrGrG+G-3’,所述逆转录反向引物包括SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述引物组合还包括cDNA扩增引物组,所述cDNA扩增引物组包括cDNA扩增正向引物和cDNA扩增反向引物;其中,所述cDNA扩增正向引物包括第二Read1序列,所述cDNA扩增反向引物包括SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列;
其中,所述第二Read1序列与第一Read1序列相同或不同。
3.根据权利要求1或2所述的引物组合,其特征在于,所述引物组合还包括巢式PCR引物组,所述巢式PCR引物组包括第一轮巢式PCR引物组;所述第一轮巢式PCR引物组的正向引物包括第三Read1序列或包括5’-第一测序接头1-第四Read1序列-3’;所述第一轮巢式PCR引物组的反向引物包括第一轮α链的反向引物和/或第一轮β链的反向引物,所述第一轮α链的反向引物包括SEQ ID NO.6或SEQ ID NO.12所示的核苷酸序列,所述第一轮β链的反向引物包括SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列;
其中,所述第三Read1序列与第二Read1序列相同或不同;和/或,第四Read1序列与第三Read1序列相同或不同;
可选地,所述第一轮巢式PCR引物组的正向引物还包括载体片段序列;和/或
所述巢式PCR引物组还包括第二轮巢式PCR引物组,所述第二轮巢式PCR引物组的正向引物包括第五Read1序列或载体片段序列或第二测序接头1;所述第二轮巢式PCR引物组的反向引物包括第二轮α链的反向引物和/或第二轮β链的反向引物,所述第二轮α链的反向引物包括SEQ ID NO.9所示的核苷酸序列或包括5’-Read2序列1-Barcode-AGTCTCTCAGCTGGTACACG-3’,所述第二轮β链的反向引物包括SEQ ID NO.10所示的核苷酸序列或包括5’-Read2序列2-Barcode-TCTGATGGCTCAAACACAGC-3’;
其中,所述第五Read1序列与第三Read1序列或第四Read1序列相同或不同,和/或,所述第一测序接头1与第二测序接头1相同或不同。
4.根据权利要求3所述的引物组合,其特征在于,所述巢式PCR引物组还包括第三轮巢式PCR引物组,所述第三轮巢式PCR引物组的正向引物包括第三测序接头1,所述第三轮巢式PCR引物组的反向引物包括测序接头2和Read2序列3;
其中,所述第三测序接头1与第二测序接头1相同或不同;
可选地,所述第一测序接头1、第二测序接头1和第三测序接头1各自独立地选自illumina测序的P5接头的至少部分序列,和/或,所述测序接头2选自illumina测序的P7接头的至少部分序列;
可选地,所述Read2序列1和Read2序列2相同或不同;和/或,Read2序列1、Read2序列2、Read2序列3各自独立的选自illumina测序的Read2的至少部分序列;和/或,Read2序列1和Read2序列3二者序列至少部分重叠;和/或,Read2序列2和Read2序列3二者序列至少部分重叠。
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