[发明专利]一种用于检测小麦抗赤霉病基因Fhb1辅助因子in1的分子标记及应用在审

专利信息
申请号: 202310016742.2 申请日: 2023-01-06
公开(公告)号: CN116004903A 公开(公告)日: 2023-04-25
发明(设计)人: 马正强;李国强;贾海燕;罗贤民;袁阳 申请(专利权)人: 南京农业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 吴爽;徐冬涛
地址: 210095 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 小麦 赤霉病 基因 fhb1 辅助 因子 in1 分子 标记 应用
【说明书】:

发明公开了一种用于检测小麦抗赤霉病基因Fhb1辅助因子in1分子标记及应用;本发明公开了检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的物质在下述(A1)至(A6)中的应用:(A1)鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性;(A2)制备鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性的产品;(A3)选育或辅助选育抗赤霉病小麦;(A4)制备选育或辅助选育抗赤霉病小麦的产品;(A5)小麦辅助育种;(A6)制备小麦辅助育种的产品;其中,所述SNP IWB5806位点为序列3第51位,位于小麦染色体5B上,物理位置为378816535bp的位点;或,所述SNP IWB5806位点的基因型为CC或TT。本发明在小麦5B染色体上检测到小麦抗赤霉病基因Fhb1抗性发挥辅助因子in1,进一步将其关联SNP标记转化为CAPS标记引物,为赤霉病抗性相关的in1在育种中的有效利用提供了工具。

技术领域

本发明属于作物育种学领域,具体涉及一种用于检测小麦抗赤霉病基因Fhb1辅助因子in1的分子标记及应用。

背景技术

赤霉病是由兼性寄生真菌引起的世界性小麦病害,可以导致高达100%的产量损失,并且能够使感病籽粒中积累真菌毒素引起严重的粮食安全和食品安全问题。近年来,由于全球气候变暖,小麦-玉米和水稻小麦轮作以及免耕栽培措施的推广应用,赤霉病在全球频繁爆发,尤其是在我国,目前80%的小麦生产区域受到赤霉病的威胁,造成的年均直接经济损失达数十亿元。和其它防治措施相比,抗病品种的选育和利用是防治赤霉病最经济有效、环保的手段。

在定位的500多个抗赤霉病QTL中,Fhb1存在于几乎所有的抗赤霉病种质中,如望水白、苏麦3号、宁7840、Chokwang、新中长等,并且提供最强、最稳定的抗赤霉病扩展效应,因此得到科学家广泛、深入的研究。Fhb1编码一个富含组氨酸的钙离子结合蛋白,在小麦中正调控赤霉病抗性。在世界范围内,许多研究表明Fhb1在许多遗传背景中能显著提高小麦的抗扩展能力,并且对一些重要的农艺性状和品质性状没有明显的负效应。

随着Fhb1功能标记的开发和利用,育种家非常渴望在育种过程中利用Fhb1来推进育种进程,提高育种效率。但是在利用Fhb1时还是存在一些问题的。并不是所有含有Fhb1的品种都能够表现为高抗赤霉病。同时将Fhb1转移到一些遗传背景中也没有发挥良好的赤霉病抗性。推测在某些遗传背景中存在Fhb1发挥功能的辅助因子。因此发掘Fhb1的辅助因子并开发与其紧密连锁的分子标记对于高效抗赤霉病育种十分关键。

发明内容

为了克服现有技术中存在的缺陷,本发明提供一种用于检测小麦抗赤霉病基因Fhb1辅助因子in1的分子标记及使用方法。本发明通过全基因组关联分析在小麦5B染色体上检测到1个小麦抗赤霉病基因Fhb1抗性发挥辅助因子in1,进一步将其关联SNP IWB5806转化成基于PCR的CAPS标记引物组,并在双亲分离群体中证明这个标记的有效性。

本发明解决其技术问题采用的技术方案是:

第一方面,本发明首先保护一种检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的基因型的物质在下述(A1)至(A6)中的应用:

(A1)鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性;

(A2)制备鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性的产品;

(A3)选育或辅助选育抗赤霉病小麦;

(A4)制备选育或辅助选育抗赤霉病小麦的产品;

(A5)小麦辅助育种;

(A6)制备小麦辅助育种的产品。

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