[发明专利]一种用于检测小麦抗赤霉病基因Fhb1辅助因子in1的分子标记及应用

权利要求书

1. 检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的基因型的物质在下述（A1）至（A6）中的应用：

（A1）鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性；

（A2）制备鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性的产品；

（A3）选育或辅助选育抗赤霉病小麦；

（A4）制备选育或辅助选育抗赤霉病小麦的产品；

（A5）小麦辅助育种；

（A6）制备小麦辅助育种的产品；

其中，所述SNP IWB5806位点为序列3第51位；或，所述SNP IWB5806位点的基因型为CC或TT。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的物质如下（B1）-（B3）：

（B1）包括用于检测小麦基因组中染色体5B上序列3所示的分子标记的第51位脱氧核糖核苷酸是TT还是CC的成套引物WGRB3860；

（B2）含有（B1）中成套引物的检测试剂；

（B3）含有（B1）中成套引物或（B2）中检测试剂的试剂盒。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，

所述WGRB3860成套引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物序列和序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物序列组成；

序列1所示的单链DNA分子的衍生物为将序列1经过一个或几个核苷酸的取代且与序列1具有相同功能的DNA分子；

序列2所示的单链DNA分子的衍生物为将序列2经过一个或几个核苷酸的取代且与序列2具有相同功能的DNA分子。

4.一种产品，其为含有权利要求1所述的检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的基因型的物质：

所述产品具有如下（C1）或（C2）至少一种功能；

（C1）鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性；

（C2）抗赤霉病小麦辅助育种。

5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的基因型的物质为如下（D1）-（D3）：

（D1）包括用于检测小麦基因组中染色体5B上序列3所示的分子标记的第51位脱氧核糖核苷酸是TT还是CC的成套引物WGRB3860；

（D2）含有（D1）中成套引物的检测试剂；

（D3）含有（D1）中成套引物或（D2）中检测试剂的试剂盒。

6.根据权利要求5所述的产品，其特征在于，

所述WGRB3860成套引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物序列和序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物序列组成；

序列1所示的单链DNA分子的衍生物为将序列1经过一个或几个核苷酸的取代且与序列1具有相同功能的DNA分子；

序列2所示的单链DNA分子的衍生物为将序列2经过一个或几个核苷酸的取代且与序列2具有相同功能的DNA分子。

7.一种鉴定或辅助鉴定小麦赤霉病抗性的方法，为检测待测小麦染色体5B的SNPIWB5806位点的基因型为TT还是CC，根据基因型判断所述待测小麦的赤霉病抗性；

SNP IWB5806位点的基因型为CC的待测小麦的赤霉病抗性高于SNP IWB5806位点的基因型为TT的待测小麦；

所述SNP IWB5806位点为序列3第51位；所述SNP IWB5806位点的基因型为CC或TT。

8.一种选育或辅助选育抗赤霉病小麦的方法，为检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的基因型为TT还是CC，选育IWB5806位点基因型为CC的待测小麦，得到抗赤霉病小麦；

所述SNP IWB5806位点为序列3第51位；所述SNP IWB5806位点的基因型为CC或TT。

9.根据权利要求7或8所述的方法，其特征在于，

检测小麦染色体5B的SNP IWB5806位点的基因型为TT还是CC的方法如下（E1）或（E2）：

（E1）90K SNP芯片分析；

（E2）用权利要求2中所述成套引物WGRB3860对所述待测小麦基因组DNA进行PCR扩增，然后用HaeIII对产物进行酶切，检测PCR产物；

如果用所述成套引物WGRB3860扩增的产物经HaeIII酶切后为572bp，则所述待测小麦SNP IWB5806位点的基因型为TT；若所述成套引物WGRB3860扩增的产物经HaeIII酶切后成为两个条带352bp和220bp，则所述待测小麦SNP IWB5806位点的基因型为CC。