[发明专利]蛋白质特征预处理方法、装置、介质及设备

权利要求书

1.一种蛋白质特征预处理方法，其特征在于，所述方法包括：

接收待处理的蛋白质；

根据所述蛋白质和训练完成的蛋白质特征预处理模型，获得所述蛋白质对应的蛋白质特征；

根据所述蛋白质对应的处理类型和所述蛋白质特征，确定所述蛋白质对应的应用蛋白质特征；

其中，所述蛋白质特征预处理模型包括共享编码器、蛋白质理解解码器和蛋白质生成解码器，所述共享编码器用于对所述蛋白质进行特征编码获得编码特征，所述蛋白质理解解码器用于对所述编码特征进行理解解码处理，获得蛋白质理解特征，所述蛋白质生成解码器用于对所述编码特征进行生成解码处理，获得蛋白质生成特征，所述蛋白质特征包括所述编码特征、所述蛋白质理解特征和所述蛋白质生成特征。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白质特征预处理模型通过以下方式确定：

获取蛋白质样本集，其中，所述蛋白质样本集中包含多个蛋白质样本；

对所述蛋白质样本进行掩码处理，获得所述蛋白质样本对应的掩码蛋白质；

将所述掩码蛋白质输入预设模型，获得所述掩码蛋白质对应的预测掩码氨基酸以及预测蛋白质，其中，所述预设模型包括共享编码器、蛋白质理解解码器和蛋白质生成解码器；

根据所述预测掩码氨基酸、所述预测蛋白质和所述蛋白质样本，确定所述预设模型的理解损失和生成损失；

根据所述理解损失和所述生成损失分别对所述预设模型中的共享编码器、所述蛋白质理解解码器和所述蛋白质生成解码器进行训练，并将训练完成的预设模型确定为所述蛋白质特征预处理模型。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述根据所述预测掩码氨基酸、所述预测蛋白质和所述蛋白质样本，确定所述预设模型的理解损失和生成损失，包括：

根据所述预测掩码氨基酸与所述掩码蛋白质对应的掩盖氨基酸，确定所述掩码损失；

根据所述预测蛋白质和所述蛋白质样本，确定所述生成损失。

4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述根据所述理解损失和所述生成损失分别对所述预设模型中的共享编码器、所述蛋白质理解解码器和所述蛋白质生成解码器进行训练，包括：

根据所述理解损失和所述生成损失对所述共享编码器的参数进行调整；

根据所述理解损失，对所述蛋白质理解解码器的参数进行调整；

根据所述生成损失，对所述蛋白质生成解码器的参数进行调整。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白质理解解码器基于BERT模型实现，所述蛋白质生成解码器基于Transformer模型的解码器实现。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述蛋白质对应的处理类型和所述蛋白质特征，确定所述蛋白质对应的应用蛋白质特征，包括：

若所述蛋白质对应的处理类型为第一类型，则将所述蛋白质对应的编码特征、或第一融合特征作为所述应用蛋白质特征，所述第一融合特征为所述编码特征与所述蛋白质理解特征形成的融合特征；

若所述蛋白质对应的处理类型为第二类型，则将所述蛋白质对应的编码特征或第二融合特征作为所述应用蛋白质特征，所述第二融合特征为所述编码特征与所述蛋白质生成特征形成的融合特征。

7.一种蛋白质特征预处理装置，其特征在于，所述装置包括：

接收模块，用于接收待处理的蛋白质；

处理模块，用于根据所述蛋白质和训练完成的蛋白质特征预处理模型，获得所述蛋白质对应的蛋白质特征；

确定模块，用于根据所述蛋白质对应的处理类型和所述蛋白质特征，确定所述蛋白质对应的应用蛋白质特征；

其中，所述蛋白质特征预处理模型包括共享编码器、蛋白质理解解码器和蛋白质生成解码器，所述共享编码器用于对所述蛋白质进行特征编码获得编码特征，所述蛋白质理解解码器用于对所述编码特征进行理解解码处理，获得蛋白质理解特征，所述蛋白质生成解码器用于对所述编码特征进行生成解码处理，获得蛋白质生成特征，所述蛋白质特征包括所述编码特征、所述蛋白质理解特征和所述蛋白质生成特征。