[发明专利]一种用于鉴别甲状腺肿瘤良恶性的甲基化分子标志物在审
申请号: | 202211580424.0 | 申请日: | 2022-12-09 |
公开(公告)号: | CN115772571A | 公开(公告)日: | 2023-03-10 |
发明(设计)人: | 张筝;张晶 | 申请(专利权)人: | 南京腾辰生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16H50/20;G16H50/70;G16H10/60;G16B30/10;G16B20/50;G16B25/20 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张立娜 |
地址: | 210032 江苏省南京市江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴别 甲状腺 肿瘤 恶性 甲基化 分子 标志 | ||
1.一种甲基化生物标志物,其特征在于:所述甲基化生物标志物的核苷酸序列为CUX2基因中如下(A1)-(A4)所示片段中的全部或部分CpG位点的甲基化水平:
(A1)SEQ ID No.1所示的DNA片段或与其具有80%以上同一性的DNA片段;
(A2)SEQ ID No.2所示的DNA片段或与其具有80%以上同一性的DNA片段;
(A3)SEQ ID No.3所示的DNA片段或与其具有80%以上同一性的DNA片段;
(A4)SEQ ID No.4所示的DNA片段或与其具有80%以上同一性的DNA片段;
所述甲基化生物标志物包括位于其核苷酸序列上的如下(B1)-(B7)中任一所示CpG位点:
(B1)CUX2基因中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示4个DNA片段中的任意一个或多个CpG位点;
(B2)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位点;
(B3)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位点;
(B4)CUX2基因中SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位点;
(B5)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位点、SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位点;
(B6)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段中的全部CpG位点或任意23个或任意22个或任意21个或任意20个或任意19个或任意18个或任意17个或任意16个或任意15个或任意14个或任意13个或任意12个或任意11个或任意10个或任意9个或任意8个或任意7个或任意6个或任意5个或任意4个或任意3个或任意2个或任意1个CpG位点;
(B7)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上如下9项所示CpG位点的全部或任意8项或任意7项或任意6项或任意5项或任意4项或任意3项或任意2项或任意1项:
第1项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第261-262位所示CpG位点;
第2项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第330-331位所示CpG位点;
第3项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第355-356位所示CpG位点;
第4项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第369-370位和第371-372位和第374-375位和第380-381位和第382-383位所示CpG位点;
第5项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第392-393位所示CpG位点;
第6项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第453-454位所示CpG位点;
第7项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第475-476位和第478-479位所示CpG位点;
第8项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第484-485位所示CpG位点;
第9项:SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第624-625位所示CpG位点;
所述甲基化生物标志物的用途为如下中的至少一种:
(1)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤;
(2)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤;
(3)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤;
(4)区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同亚型;
(5)区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同分期。
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