[发明专利]胞嘧啶脱氨酶、包含其的碱基编辑系统及其应用在审
| 申请号: | 202211458040.1 | 申请日: | 2022-11-16 |
| 公开(公告)号: | CN116103271A | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
| 发明(设计)人: | 郭俊璠;乔云波;张玉 | 申请(专利权)人: | 上海科技大学 |
| 主分类号: | C12N9/78 | 分类号: | C12N9/78;C07K19/00;C12N9/22;C12N15/85;C12N15/62 |
| 代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 水文钰;黄益澍 |
| 地址: | 201210 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 胞嘧啶 脱氨酶 包含 碱基 编辑 系统 及其 应用 | ||
1.一种胞嘧啶脱氨酶,其特征在于,所述胞嘧啶脱氨酶包含与如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列具有至少80%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列一致性的氨基酸序列。
2.一种多肽复合物,其特征在于,所述多肽复合物包括第一多肽和第二多肽;
其中,所述第一多肽包含与如SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列具有至少80%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列一致性的氨基酸序列;所述第二多肽包含与如SEQ IDNO:30所示的氨基酸序列具有至少80%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列一致性的氨基酸序列;
可选地,所述第一多肽与第二多肽连接。
3.一种融合蛋白的组合,其特征在于,所述融合蛋白的组合包括第一融合蛋白和第二融合蛋白;所述第一融合蛋白包括第一多肽和第一核酸酶,所述第二融合蛋白包括第二多肽和第二核酸酶;
其中,所述第一核酸酶与所述第二核酸酶在DNA链上产生断裂;所述第一核酸酶与所述第二核酸酶的识别位点不同;所述第一多肽与第二多肽在结合状态下将胞嘧啶编辑为胸腺嘧啶;
较佳地,所述第一核酸酶与所述第二核酸酶选自VQR-spCas9、VRER-spCas9、spRY、spNG、SaCas9-KKH和SaCas9-NG。
4.如权利要求3所述的组合,其特征在于,所述第一融合蛋白和/或第二融合蛋白还包括核定位信号序列片段;
和/或,所述第一融合蛋白和/或第二融合蛋白还包括尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂片段;
和/或,所述第一融合蛋白和/或第二融合蛋白还包括转录激活结构域片段;
较佳地:
所述核定位信号序列片段位于所述第一融合蛋白和/或第二融合蛋白的N端和/或C端;和/或,所述尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂片段位于所述第一融合蛋白和/或第二融合蛋白的C端;和/或,所述转录激活结构域片段位于所述第一融合蛋白和/或第二融合蛋白的C端;和/或,所述核定位信号序列片段、所述尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂片段和所述转录激活结构域片段与所述第一多肽、第二多肽、第一核酸酶和/或第二核酸酶通过连接子连接;
更佳地:
所述第一融合蛋白自N端至C端依次包括:核定位信号序列片段、第一多肽、第一核酸酶、尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂片段、核定位信号序列片段和转录激活结构域片段;和/或,
所述第二融合蛋白自N端至C端依次包括:核定位信号序列片段、第二多肽、第二核酸酶、尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂片段、核定位信号序列片段和转录激活结构域片段。
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