[发明专利]确定分子的构象的方法、装置、电子设备和介质

说明书

本公开的实施例涉及确定分子的构象的方法、装置、电子设备和介质。该方法包括基于分子的二维结构，将分子切分成多个分子片段，多个分子片段中的至少一个分子片段包括多个原子。该方法还包括确定多个分子片段中的相邻分子片段之间的多个二面角。该方法还包括将多个分子片段和多个二面角的多个组合确定为分子的多个构象。通过本公开的实施例，能够降低在预测分子的构象时需要建模的构象模型的自由度，也能够提高分子的构象的预测多样性和预测精度。

技术领域

本公开的实施例涉及计算机领域，并且更具体地，涉及确定分子的构象的方法、装置、电子设备和介质。

背景技术

基于分子的二维结构来解析分子三维结构是研究药物分子活性和相关理化性质的基础和关键的步骤。近年来，人工智能技术在分子三维结构预测中取得突破性进展。相比于传统的晶体衍射和冷冻电镜等实验方法和基于分子动力学和密度泛函的计算模拟方法，人工智能技术可以高通量地解析分子三维结构，从而大幅加速新药的研发速度。

因此，分子的构象生成是分子三维结构预测的重要任务。该任务主要流程是基于输入的二维的分子结构图来预测稳定的分子三维构象。构象生成任务关注分子构建在三维空间中的平移不变性，以及原子之间的化学键的键长和键角。

发明内容

本公开的实施例提供了一种确定分子的构象的方法、装置、电子设备和计算机可读存储介质。

根据本公开的第一方面，提供了一种确定分子的构象的方法。该方法包括基于分子的二维结构，将分子切分成多个分子片段，多个分子片段中的至少一个分子片段包括多个原子。该方法还包括确定多个分子片段中的相邻分子片段之间的多个二面角。该方法还包括将多个分子片段和多个二面角的多个组合确定为分子的多个构象。

根据本公开的第二方面，提供了一种确定分子的构象的装置。该装置包括分子切分模块，被配置为基于分子的二维结构，将分子切分成多个分子片段，多个分子片段中的至少一个分子片段包括多个原子。该装置还包括二面角确定模块，被配置为确定多个分子片段中的相邻分子片段之间的多个二面角。该装置还包括构象组合模块，被配置为将多个分子片段和多个二面角的多个组合确定为分子的多个构象。

根据本公开的第三方面，提供了一种电子设备。该电子设备包括处理器以及与处理器耦合的存储器，存储器具有存储于其中的指令，指令在被处理器执行时使电子设备执行根据第一方面所述的方法。

根据本公开的第四方面，提供了一种计算机可读存储介质。该计算机可读存储介质上存储有一条或多条计算机指令，其中一条或多条计算机指令被处理器执行以实现根据第一方面所述的方法。

提供发明内容部分是为了以简化的形式来介绍对概念的选择，它们在下文的具体实施方式中将被进一步描述。发明内容部分无意标识要求保护的主题的关键特征或主要特征，也无意限制要求保护的主题的范围。

附图说明

结合附图并参考以下详细说明，本公开各实施例的上述和其它特征、优点及方面将变得更加明显。在附图中，相同或相似的附图标记表示相同或相似的元素，其中：

图1示出了根据本公开的一些实施例的确定分子的构象的方法可以在其中实现的示例环境的示意图；

图2示出了根据本公开的一些实施例的确定分子的构象的方法的流程图；

图3示出了根据本公开的一些实施例的确定分子的构象的过程的框图；

图4示出了根据本公开的一些实施例的分子构象场的示意图；

图5A示出了根据本公开的一些实施例的构建片段库的方法的流程图；

图5B示出了根据本公开的一些实施例的构建片段库的过程的框图。

图6A示出了根据本公开的一些实施例的确定能量分布的方法的流程图；