[发明专利]确定分子的构象的方法、装置、电子设备和介质

权利要求书

1.一种确定分子的构象的方法，包括：

基于所述分子的二维结构，将所述分子切分成多个分子片段，所述多个分子片段中的至少一个分子片段包括多个原子；

确定所述多个分子片段中的相邻分子片段之间的多个二面角；以及

将所述多个分子片段和所述多个二面角的多个组合确定为所述分子的多个构象。

2.根据权利要求1所述的方法，其中将所述分子切分成多个分子片段包括：

基于所述分子的片段库，确定所述分子的多个切分方案；

将所述多个切分方案中的具有最小自由度的切分方案确定为目标切分方案；以及

根据所述目标切分方案，确定所述分子的所述多个分子片段。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述片段库通过以下方式构建：

获取多个样本分子的多个样本构象以及与所述多个样本构象相对应的多个样本二维结构；

切分所述多个样本构象和所述多个样本二维结构以获取多个样本片段构象和与所述多个样本片段构象相对应的多个样本分子片段；

确定所述多个样本片段构象和所述多个样本分子片段的多个相关性；

基于所述多个相关性对所述多个样本片段构象进行聚类以获取多个聚类中心；以及

将所述多个聚类中心添加到所述片段库。

4.根据权利要求3所述的方法，其中将所述多个切分方案中的具有最小自由度的切分方案确定为目标切分方案包括：

确定所述分子的所述多个片段构象和对应的多个聚类中心的均方根偏差的多个方差；以及

将所述多个方差的和确定为所述切分方案的自由度。

5.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述多个分子片段中的相邻分子片段之间的多个二面角包括：

基于所述分子的能量分布，确定所述多个二面角和多个片段构象。

6.根据权利要求5所述的方法，还包括：

确定所述多个分子片段的多个特征向量；以及

基于所述多个特征向量和所述多个二面角，确定所述分子的所述能量分布。

7.根据权利要求6所述的方法，其中确定所述分子的所述能量分布包括：

针对所述多个分子片段中的每个分子片段，确定与每个分子片段相关联的第一能量分布；

针对所述多个二面角中的每个二面角，确定与每个二面角相关联的第二能量分布；

基于所述每个分子片段和所述每个二面角，确定与每个分子片段和所述每个二面角相关联的第三能量分布；以及

基于所述第一能量分布、所述第二能量分布和所述第三能量分布，确定与所述多个分子片段和所述多个二面角相关联的联合概率分布作为所述能量分布。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中将所述多个分子片段和所述多个二面角的多个组合确定为所述分子的多个构象包括：

基于所述分子的能量分布，在所述分子的所述多个分子片段中采样多个候选片段构象；

基于所述分子的所述能量分布，在所述分子的所述多个二面角中采样多个候选二面角；

将所述多个候选片段构象和所述多个候选二面角进行多次组合；以及

将获取的多个组合确定为所述分子的所述多个构象。

9.根据权利要求8所述的方法，还包括：

确定标识所述多个分子片段和所述多个二面角的连接关系的拓扑图；

将所述多个分子片段和所述多个二面角确定为所述拓扑图的多个节点；以及

基于所述分子的能量分布，在所述拓扑图的所述多个节点中采样多个候选节点。

10.根据权利要求9所述的方法，其中基于所述分子的能量分布，在所述拓扑图的所述多个节点中采样多个候选节点包括：

选择所述多个节点中的一个节点；

保持所述多个节点中的其他节点不变；

更新所述分子的所述能量分布；以及

基于更新后的所述能量分布，针对所述一个节点确定所述多个候选节点。