[发明专利]一种非典型毕赤酵母基因编辑系统及其应用在审
| 申请号: | 202211314074.3 | 申请日: | 2022-10-25 |
| 公开(公告)号: | CN116179576A | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
| 发明(设计)人: | 金城;马加胤 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微生物研究所 |
| 主分类号: | C12N15/55 | 分类号: | C12N15/55;C12N15/11;C12N15/113;C12N15/81;C12N15/66;C12N1/19;C12R1/84 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 李正 |
| 地址: | 100101 北京市朝阳区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 非典型 酵母 基因 编辑 系统 及其 应用 | ||
1.一种适用于PK酵母编辑的Cas9基因,其特征在于,所述Cas9基因的核苷酸序列如SEQID NO.1所示。
2.一种引物对,其特征在于,所述引物对的序列如SEQ ID NO.14-15所示,用于扩增权利要求1所述的Cas9基因。
3.一种PK酵母基因编辑质粒,其特征在于,所述PK酵母基因编辑质粒包括:原核复制起点、抗性筛选标记基因、Cas9基因表达盒、gRNA基因表达盒和自主复制序列;
所述Cas9基因表达盒含有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。
4.根据权利要求3所述的PK酵母基因编辑质粒,其特征在于:
所述Cas9基因表达盒从上游至下游依次包括Cas9基因启动子、Cas9基因和终止子;
所述Cas9基因启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述Cas9基因终止子的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
5.根据权利要求4所述的PK酵母基因编辑质粒,其特征在于,所述gRNA基因表达盒从上游至下游依次包括RNA polⅢ启动子、tRNALeu、引导序列、scaffold RNA序列和polyT;
优选地,所述gRNA基因表达盒由SEQ ID NO.6-7所示引物对扩增得到;
更优选地,所述gRNA基因表达盒的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
6.根据权利要求5所述的PK酵母基因编辑质粒,其特征在于,所述自主复制序列为酿酒酵母的ARS序列;所述ARS序列由SEQ ID NO.12-13所示引物对扩增得到;
优选地,所述ARS序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
7.根据权利要求6所述的PK酵母基因编辑质粒,其特征在于,所述筛选标记基因为氨苄青霉素抗性基因和博来霉素抗性基因;所述原核复制起点为pBR322的复制起始点。
8.权利要求3-7任一项所述PK酵母基因编辑质粒的构建方法,其特征在于,
以PK酵母基因组DNA为模板PCR扩增得到Cas9基因启动子和Cas9基因终止子;以合成质粒为模板PCR扩增得到gRNA基因表达盒和自主复制序列;
将SEQ ID NO.1-5所示的序列,连接到载体上,构建基因编辑质粒pk-Cas9,并转化大肠杆菌DH5α,获得重组质粒pk-Cas9。
9.权利要求1-2任一项所述的Cas9基因或权利要求3-7任一项所述的PK酵母基因编辑质粒在高效编辑PK酵母中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,将感受态库德里阿兹威氏毕赤酵母,与pk-Cas9质粒和供体DNA混匀,冰浴后,电击转化,电击后立即加入山梨醇和YPD培养基中,进行复苏,获得编辑后的PK酵母。
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