[发明专利]一种活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法及其应用在审
申请号: | 202211187614.6 | 申请日: | 2022-09-28 |
公开(公告)号: | CN116024207A | 公开(公告)日: | 2023-04-28 |
发明(设计)人: | 姚韩韩;董迎辉;赵家熙;何琳;何京;吕丽媛;孙长森;林志华 | 申请(专利权)人: | 浙江万里学院;浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 宁波甬致专利代理有限公司 33228 | 代理人: | 李迎春 |
地址: | 315000 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 活体 损伤 提取 贝类 质量 dna 方法 及其 应用 | ||
1.一种活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:壳皮采集:将健康无病、活力好的待检贝类活体清洗解剖后得到条状和/或块状壳皮;
S2:壳皮清洗:将所述步骤S1得到的壳皮放入离心管中,加水并进行震荡;然后将所述壳皮转移到另一离心管中,重复上述步骤,从而除去壳皮表面的污物、细菌;
S3:DNA提取:包括:
S31:取壳皮组织置于研钵中,加入液氮研磨至粉状,转移至离心管中;加入STE裂解缓冲液,再加入SDS溶液和蛋白酶K,充分混匀,置于恒温水浴锅中消化过夜,直至裂解液澄清;
S32:加入等体积的酚/氯仿/异戊醇,混匀、抽提后离心处理;取上清液,加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1),混匀、抽提10min,12000rpm离心10min;
S33:取上清液,加入NaAc,无水乙醇,缓慢摇匀,置于-20℃冰箱中以进行沉淀;离心后得到DNA沉淀;
S34:弃去上清,用乙醇溶液洗涤所述步骤S33得到的沉淀;之后离心并弃去上清液,将得到的DNA沉淀在通风橱中进行干燥处理,加入灭菌双蒸水溶解DNA沉淀得到DNA溶液,完成提取。
2.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S34完成提取后还包括步骤S35:取步骤S4制备得到的DNA溶液进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,其余置于-20℃冰箱保存备用。
3.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S1中,所述清洗解剖包括:将待检贝类活体放置于解剖盘中,用软毛刷蘸蒸馏水充分清洗壳表的污物,用解剖刀沿着壳口平行方向轻切壳边缘的新鲜壳皮,然后用镊子撕下条状和/或块状壳皮。
4.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S2中,所述震荡为间歇震荡,且所述震荡的时间为1-2min。
5.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S31中,所述SDS溶液的浓度为10%,所述蛋白酶K的浓度为20mg/mL。
6.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S32中,所述混匀、抽提后离心处理包括:混匀、抽提10min后继续以12000rpm的速度离心10min;且所述混匀、抽提后离心处理的次数为4次。
7.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S33中,所述离心的条件为在4℃,以13000rpm的速度离心10min。
8.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S34中,所述乙醇溶液的浓度为70%,所述离心的条件为:在4℃,以10000rpm的速度离心2min,且所述离心并弃去上清液的次数为2次。
9.根据权利要求1所述的活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法,其特征在于:所述步骤S34中,所述干燥处理的条件为:将DNA沉淀置于通风橱中吹3-5min至干燥。
10.一种权利要求1-9任一项所述活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法的应用,其特征在于:所述应用包括将所述方法应用在缢蛏毛蚶焦河蓝蛤管角螺的DNA提取上。
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