[发明专利]检测抗性看麦娘的特异性引物组及其LAMP试剂盒以及方法在审
| 申请号: | 202211166875.X | 申请日: | 2022-09-23 |
| 公开(公告)号: | CN115852023A | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
| 发明(设计)人: | 赵宁;操海群;廖敏;王玛丽;唐智 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 杭州华进联浙知识产权代理有限公司 33250 | 代理人: | 储照良 |
| 地址: | 230031 安徽省合肥市蜀*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 抗性 看麦娘 特异性 引物 及其 lamp 试剂盒 以及 方法 | ||
1.一种检测抗性看麦娘的特异性引物组,其特征在于,所述特异性引物组包括由正向外引物F3和反向外引物B3组成的第一特异性引物对,以及由正向内引物FIP和反向内引物BIP组成的第二特异性引物对,其中,
所述正向外引物F3的核苷酸序列为:5’GAGGGATTCCTGTTGGTGTT3’;
所述反向外引物B3的核苷酸序列为:5’TTAGCTTCAAAAAGATCTCTTTGTCC3’;
所述正向内引物FIP的核苷酸序列为:5’GGAACAGACCGCTCATGGGAACCATGATGCAGCTCGTCC3’;
所述反向内引物BIP的核苷酸序列为:5’TCTGCTACCAAGACAGCGCAGGCCTCTCCAGTTAGCAAGG3’。
2.一种检测抗性看麦娘的LAMP试剂盒,其特征在于,所述LAMP试剂盒包括如权利要求1所述的特异性引物组。
3.根据权利要求2所述的检测抗性看麦娘的LAMP试剂盒,其特征在于,所述第一特异性引物对与所述第二特异性引物对的质量比为1:50-5:4。
4.根据权利要求2所述的检测抗性看麦娘的LAMP试剂盒,其特征在于,所述LAMP试剂盒中,正向内引物FIP的浓度为35μmol/L-45μmol/L,反向内引物BIP的浓度为35μmol/L-45μmol/L,正向外引物F3的浓度为3μmol/L-7μmol/L,反向外引物B3的浓度为3μmol/L-7μmol/L。
5.根据权利要求2-4任一项所述的检测抗性看麦娘的LAMP试剂盒,其特征在于,所述LAMP试剂盒中还包括有10×扩增缓冲液、dNTP、MgSO4、Bst DNA聚合酶、甜菜碱、基因组DNA和水。
6.一种抗性看麦娘的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
提取待测样品的基因组DNA,作为模板DNA;
将所述模板DNA与如权利要求1所述的特异性引物组配置形成LAMP反应体系,或者,将所述模板DNA与如权利要求2-5任一项所述的LAMP试剂盒配置形成LAMP反应体系;
使所述LAMP反应体系进行扩增反应,得到扩增产物;
将所述扩增产物进行凝胶电泳,根据条带分析结果,或者,向所述扩增产物中加入荧光染料得到反应产物,根据所述反应产物的RGB值分析结果。
7.根据权利要求6所述的抗性看麦娘的检测方法,其特征在于,以25μL的所述LAMP反应体系的体积计,其中,包括浓度为90mmol/L-110mmol/L的所述MgSO4,3mol/L-5mol/L的所述甜菜碱,5μmol/L-40μmol/L的所述特异性引物组,4U-16U的所述Bst DNA聚合酶,0.5μL-1.5μL的所述模板DNA,1μL-5μL的所述10×扩增缓冲液,余量为水。
8.根据权利要求6或7所述的抗性看麦娘的检测方法,其特征在于,使所述LAMP反应体系进行扩增反应的步骤中,温度为60℃-65℃,时间为45min-60min,或,分两个阶段进行,第一阶段的温度为60℃-65℃,时间为45min-60min;第二阶段的温度为80℃,时间为10min。
9.根据权利要求6或7所述的抗性看麦娘的检测方法,其特征在于,向所述扩增产物中加入荧光染料的步骤中,每毫升扩增产物中加入0.01mL-0.02mL的荧光染料。
10.根据权利要求6或7所述的抗性看麦娘的检测方法,其特征在于,所述荧光染料选自SYBR Green I、HNB或钙黄绿素中的至少一种。
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