[发明专利]一种SCN1A突变体蛋白、SCN1A基因突变体、扩增引物、检测试剂及应用

说明书

本发明属于医学诊断技术领域，具体涉及一种SCN1A突变体蛋白、SCN1A基因突变体、扩增引物、检测试剂及应用。本发明首次发现包括p.R1384Ifs*4的突变蛋白SCN1A与Dravet综合征相关，通过检测是否存在p.R1384Ifs*4或者编码p.R1384Ifs*4的突变基因，能够检测Dravet综合征。本发明提供的SCN1A突变体蛋白可以将Dravet综合征患者和正常人群区分开，是一种诊断Dravet综合征的生物标志物，有助于Dravet综合征基因突变的筛查和诊断，并为其药物筛选、药效评价及靶向治疗提供新的技术支持。

技术领域

本发明属于医学诊断技术领域，具体涉及一种SCN1A突变体蛋白、SCN1A基因突变体、扩增引物、检测试剂及应用。

背景技术

Dravet综合征(Dravet syndrome，DS)(MIM 182389)，是一种临床少见的癫痫综合征，以婴儿期起病、发作形式多样、精神运动发育迟滞、药物难治性等为主要特征，是难治性癫痫的代表综合征。DS发病率1/40000～1/20000，男女比例约为2:1；占小儿各型肌阵挛性癫痫的29.5％，占1岁以内婴幼儿癫痫的3％，3岁以内婴幼儿癫痫的7％，患儿早期死亡风险高达10％。

SCN1A基因是定位于染色体2q24.3，包括29个外显子和28个内含子，基因长142.2kb，编码2009个氨基酸的钠离子通道α1亚单位，研究报道70％～80％的Dravet综合征患者是由SCN1A突变导致的常染色体显性遗传病。少数未携带SCN1A基因突变的女性患者被发现携带PCDH19基因的变异(约占5％)，该基因编码原钙粘蛋白19，与神经元的连接和突触膜上信号转导有关。除此之外，目前已知的致病基因还包括SCN1A、SCN2A、SCN8A、SCN9A、SCN1B、PCDH19、GABRA1、GABRG2、STXBP1、HCN1、CHD2、KCNA2等基因，遗传方式包括常染色体显性遗传和X连锁隐性遗传等。与其他遗传性癫痫脑病相似，大多数DS病例为新生突变。

基因突变是导致Dravet综合征发生发展的重要遗传基础，基因诊断是确诊Dravet综合征的重要遗传学标准。临床上需要针对不同突变建立相应的检测技术并用于明确病因和疾病诊断，发现与Dravet综合征相关的突变，助力Dravet综合征基因突变的筛查和诊断，并为其药物筛选、药效评价及靶向治疗，具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种SCN1A突变体蛋白、SCN1A基因突变体、扩增引物、检测试剂及应用，丰富Dravet综合征的致病突变谱，精准判断Dravet综合征，用于Dravet综合征的遗传学诊断以指导治疗，以及胚胎植入前遗传学诊断和优生优育。

本发明提供了一种导致Dravet综合征的SCN1A突变体蛋白，所述SCN1A突变体蛋白包括p.R1384Ifs*4。

本发明还提供了编码上述技术方案所述SCN1A突变体蛋白的SCN1A基因突变体，所述SCN1A基因突变体包括c.4151delinsTCGAA。

本发明还提供了上述技术方案所述SCN1A基因突变体作为检测靶点在制备试剂和/或试剂盒中的应用：

所述试剂包括检测Dravet综合征的试剂；

所述试剂盒包括诊断Dravet综合征、孕前遗传病筛查、产前遗传病筛查、孕前遗传病诊断、产前遗传病、辅助治疗Dravet综合征中的一种或多种的试剂盒。

本发明还提供了一种检测上述技术方案所述的SCN1A基因突变体的引物组合，所述引物组合包括扩增引物；

所述扩增引物包括上游引物SCN1A-F和下游引物SCN1A-R；所述SCN1A-F包括如SEQID NO.1所示的核苷酸序列；所述SCN1A-R包括如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。