[发明专利]与绵羊产羔数性状相关的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.与绵羊产羔数性状相关的SNP分子标记，其特征在于，其含有如SEQ ID NO.1所示序列第100位多态性为A/G的核苷酸序列。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记具有第100位的多态性的位点的基因型为AA或GA，对应于绵羊产羔数多；基因型为GG，对应于绵羊产羔数少。

3.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物组合，其特征在于，包括正向引物、反向引物和延伸引物，所述正向引物、反向引物和延伸引物的核苷酸序列分别如SEQ IDNO.2-4所示。

4.含有权利要求3所述引物组合的试剂或试剂盒。

5.权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的引物组合或权利要求4所述的试剂或试剂盒的以下任一应用：

(1)在鉴定绵羊产羔数性状表型中的应用；

(2)在绵羊品种改良或分子标记辅助育种中的应用；

(3)在绵羊产羔数性状早期预测中的应用；

(4)在筛选高产羔数绵羊中的应用。

6.一种绵羊产羔数性状早期预测的方法，其特征在于，以待测绵羊基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO.2-3所示引物对进行PCR扩增反应；使用SAP酶消化PCR产物，以消化后的PCR产物作为模板，使用SEQ ID NO.4所示引物进行延伸反应；对延伸产物进行分析，确定SEQID NO.1所示序列第100位的多态性位点的基因型；

若SEQ ID NO.1所示序列第100位的多态性位点的基因型为AA或GA，则预测待测绵羊产羔数多；若SEQ ID NO.1所示序列第100位的多态性位点的基因型为GG，则预测待测绵羊产羔数少。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增反应的程序包括：94℃120s；94℃20s，56℃30s，72℃60s，45个循环；每5ul所述PCR扩增反应的体系包括：基因组DNA10ng,10×PCR反应缓冲液0.5ul，25mM MgCl₂ 0.3ul，25mM dNTPs 0.1ul,0.5μM PCRPrimer mix 1ul,5U/μL Taq DNA聚合酶0.2ul，余量为去离子水。

8.根据权利要求6或7所述的方法，其特征在于，每2ul SAP酶消化的体系包括：10×SAPBuffer 0.15ul，1.7U/ul SAP 0.26ul，余量为去离子水；SAP酶消化的反应程序为：37℃40min，85℃5min。

9.根据权利要求6-8任一项所述的方法，其特征在于，每2ul所述延伸反应的体系为：10×iPLEX buffer plus 0.17ul，IPLEX terminator0.17ul，0.6-1.3uM Primer Mix0.69ul，IPLEX enzyme 0.04ul，余量为去离子水；所述延伸反应的条件为：94℃30s；[94℃5s，(52℃5s，80℃5s)5个内部循环]，40个外部循环；72℃180s。

10.根据权利要求6-9任一项所述的方法，其特征在于，分析延伸产物的方法为质谱检测法。