[发明专利]一种用于BCR基因重排检测的参考品及其制备方法和应用在审

专利信息
申请号: 202210932678.8 申请日: 2022-08-04
公开(公告)号: CN116042769A 公开(公告)日: 2023-05-02
发明(设计)人: 林东旭;冯瑞杰;顾凯丽;刘佳;张亚飞 申请(专利权)人: 迈杰转化医学研究(苏州)有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 边人洲
地址: 215000 江苏省苏州市苏州工*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 bcr 基因 重排 检测 参考 及其 制备 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述方法包括:

取IgH、IgK和IgL重排组合不同的BCR基因样本,所述BCR基因样本选自肿瘤细胞系、肿瘤细胞系中基因组或人工合成的BCR基因;

利用ddPCR对所述BCR基因样本中BCR基因进行定量,得到各BCR基因样本中BCR基因的拷贝数,按检测需求的BCR基因的拷贝数比例,将各BCR基因样本混合,即得到所述用于BCR基因重排检测的参考品。

2.根据权利要求1所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述肿瘤细胞系包括急性淋巴白血病细胞系和/或多发性骨髓瘤细胞系。

3.根据权利要求1所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述BCR基因样本选自IGHV3-11*06基因、IGHV3-53*01基因、IGHV3-25*01基因、IGHV3-21*06基因、IGHV3-64*02基因、IGHV3-23*02基因、IGHV3-73*01基因、IGHV3-23*01基因、IGHV3-64*01基因、IGHV1-8*01基因、IGHV4-28*01基因、IGHV6-1*01基因、IGKV1-12*01基因、IGKV1-27*01基因、IGKV1-5*01基因、IGKV1D-13*01基因、IGKV1D-33*01基因、IGKV1-NL1*01基因、IGKV2D-40*01基因、IGKV5-2*01基因、IGKV6-21*01基因、IGLV1-47*02基因、IGLV2-11*01基因、IGLV3-25*02基因、IGLV10-54*02基因、IGLV8-61*01基因、IGLV6-57*02基因、IGLV4-60*03基因或IGLV3-25*02基因中的任意一种或至少两种的组合。

4.根据权利要求1所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述ddPCR的程序为:

抗干扰:93~98℃、8~12min;

预变性:93~98℃、25~35s;

变性:55~65℃、55~65s,30~50个循环;

退火、延伸:10~15℃。

5.根据权利要求2所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述急性淋巴白血病细胞系包括Reh和/或SUP-B15,所述多发性骨髓瘤细胞系包括IM-9和/或U266B1。

6.根据权利要求5所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述急性淋巴白血病细胞系的ddPCR的上游引物的核酸序列包括SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.5所示的序列,下游引物的核酸序列包括SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4或SEQ IDNO.6所示的序列,探针包括SEQ ID NO.7~SEQ ID NO.9所示的序列中任意一种。

7.根据权利要求5所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述多发性骨髓瘤细胞系的ddPCR的上游引物的核酸序列包括SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12或SEQ ID NO.15所示的序列,下游引物的核酸序列包括SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13或SEQID NO.16所示的序列,探针包括SEQ ID NO.16~SEQ ID NO.18所示的序列中任意一种。

8.一种用于BCR基因重排检测的参考品,其特征在于,所述参考品由权利要求1-7任一项所述的用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法制备得到。

9.权利要求8所述的用于BCR基因重排检测的参考品在制备BCR基因重排检测产品中的应用。

10.权利要求8所述的用于BCR基因重排检测的参考品在以非疾病诊断和/或治疗为目的的BCR基因重排检测中的应用。

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