[发明专利]区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记及方法

说明书

本发明公开了区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记及方法，属于植物分子鉴定技术领域。本发明分子标记包括分子标记1和/或分子标记4，分子标记1包括SEQ ID NO：1所示核苷酸序列中的2个SNP位点：第34位的SNP位点C/A和第38位的SNP位点G/T；分子标记4包括SEQ ID NO：2所示核苷酸序列中：第4‑6位的INDEL位点TCG/GAT和第127位的SNP位点A/G。利用本发明分子标记及方法能够有效区分川党参、羊乳和秦岭党参，有利于党参属物种分类以及党参属物种衍生的药用产品判别。

技术领域

本发明属于植物分子鉴定技术领域，具体涉及区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记及方法。

背景技术

党参属物种(川党参Codonopsis pilosula subsp.tangshen，羊乳Codonopsislanceolata，秦岭党参Codonopsis tsinlingensis)之间形态特征高度相似，在药用过程中常存在混用的情况，为了确保党参属中药材的安全和有效使用，需要对容易混淆的党参属物种进行准确鉴定。

基于DNA的标记物适合于药用植物的鉴别；其中，主要有三种DNA条形码标记：通用(universal)、超级(super)和特异(specific)DNA条形码。

通用(universal)DNA条形码适用于所有药用植物，这类标记包括ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK，可作为鉴别样品的第一线工具，但其主要用于远缘物种的鉴别，缺乏对密切相关物种的鉴别能力。

完整的叶绿体已被认为是区分相关物种的超级条形码，表现出较高的鉴别能力和足够的可靠性。然而，由于可用的DNA数量不足、组装完整的基因组及产生足够的原始数据以组装完整的基因组的测序费用昂贵、数据分析的复杂性等原因，超级DNA条形码使用受到一定限制。

从高变异区寻找特异的条形码可实现通用DNA条形码和超级DNA条形码的权衡，在缩短时间、降低成本的同时保证密切相关物种鉴定的准确性。因此，亟待提供一种区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的特异DNA条形码。

发明内容

本发明公开了区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记及方法，将其用于川党参、羊乳和秦岭党参的鉴定，结果准确可靠。

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记，

分子标记1包括SEQ ID NO：1所示核苷酸序列中的2个SNP位点：

第34位的SNP位点C/A和第38位的SNP位点G/T；

SEQ ID NO：1为TCGTACAAGTATTTTAGCAATACTTTCACTGATMGTAKTAAATGCTATTCGAAC；

分子标记4包括SEQ ID NO：2所示核苷酸序列中：

第4-6位的INDEL位点TCG/GAT和第127位的SNP位点A/G；

SEQ ID NO：2为ATCKMKCCTCTATTTTCTACTTTTCTTGAAAAAGTGTTTTCTCTCTTTGATTTCTTGTCTATCTTCTTTCATCTTCTCTAGTAGGGAATTCAATTAGTATTCTAATTGAATTGTTAATAGCAGTAARGATTCTG。

进一步地，分子标记1中，

川党参的2个SNP位点分别为A、T；

羊乳的2个SNP位点分别为C、G；

秦岭党参的2个SNP位点分别为A、G；

分子标记4中，