[发明专利]区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记及方法在审
| 申请号: | 202210793762.6 | 申请日: | 2022-07-05 |
| 公开(公告)号: | CN115838817A | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
| 发明(设计)人: | 刘昶;岳靖雯 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院药用植物研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 田立媛 |
| 地址: | 100089 北京市海淀区马连*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 区分 党参 秦岭 物种 分子 标记 方法 | ||
1.区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记,其特征在于,
所述分子标记包括分子标记1和/或分子标记4,
所述分子标记1包括SEQ ID NO:1所示核苷酸序列中的2个SNP位点:
第34位的SNP位点C/A和第38位的SNP位点G/T;
SEQ ID NO:1为TCGTACAAGTATTTTAGCAATACTTTCACTGATMGTAKTAAATGCTATTCGAAC;
所述分子标记4包括SEQ ID NO:2所示核苷酸序列中:
第4-6位的INDEL位点TCG/GAT和第127位的SNP位点A/G;
SEQ ID NO:2为ATCKMKCCTCTATTTTCTACTTTTCTTGAAAAAGTGTTTTCTCTCTTTGATTTCTTGTCTATCTTCTTTCATCTTCTCTAGTAGGGAATTCAATTAGTATTCTAATTGAATTGTTAATAGCAGTAARGATTCTG。
2.根据权利要求1所述的区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记,其特征在于,
所述分子标记1中,
川党参的2个SNP位点分别为A、T;
羊乳的2个SNP位点分别为C、G;
秦岭党参的2个SNP位点分别为A、G;
所述分子标记4中,
川党参的INDEL位点为TCG,SNP位点为A;
羊乳的INDEL位点为GAT,SNP位点为A;
秦岭党参的INDEL位点为TCG,SNP位点为G。
3.基于权利要求1或2所述区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的分子标记的引物,其特征在于,
分子标记1的引物为:
上游引物:5’-GTCATTATCCCTCGAGAAGTAG-3’,SEQ ID NO:3;
下游引物:5’-GCTGACCTGCTAACCTCTATAC-3’,SEQ ID NO:4;
分子标记4的引物为:
上游引物:5’-TAGAAGGTGGGTTGAAAGGAGT-3’,SEQ ID NO:5;
下游引物:5’-AGCCTACTCTCAAAATCGAACC-3’,SEQ ID NO:6。
4.权利要求1或2所述分子标记或权利要求3所述引物在区分川党参、羊乳和秦岭党参物种中的应用。
5.区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3所述引物。
6.区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)取待检测样品,提取DNA;
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板,使用权利要求3所述引物进行PCR扩增;
(3)对步骤(2)扩增产物进行测序。
7.根据权利要求6所述的区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的方法,其特征在于,
步骤(2)中扩增体系为:
2×Taq PCR Master Mix 25μL,每个引物1μM,模板DNA 1μL,加ddH2O至最终体积为50μL。
8.根据权利要求6所述的区分川党参、羊乳和秦岭党参物种的方法,其特征在于,
步骤(2)中扩增程序为:
94℃变性2min;
94℃30s,退火温度30s,72℃60s,35个循环;
72℃2min。
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