[发明专利]一种用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品及其制备方法在审

专利信息
申请号: 202210751740.3 申请日: 2022-06-29
公开(公告)号: CN114875181A 公开(公告)日: 2022-08-09
发明(设计)人: 李菁华;程英;侯晓梅;刘楚新;刘清波;林欣欣;其他发明人请求不公开姓名 申请(专利权)人: 菁良基因科技(深圳)有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6806;C12N5/10;C12N15/85;C12R1/93
代理公司: 广东金穗知识产权代理事务所(普通合伙) 44852 代理人: 何敏斌
地址: 518083 广东省深圳市盐田区海山街道田东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 乳头 病毒 分子 检测 质控品 及其 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的质控品为含有HPV全基因组的人卵巢癌细胞系制备的质控品。

2.根据权利要求1所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的含有HPV全基因组的人卵巢癌细胞系为通过将HPV全基因组整合到人卵巢癌细胞系ovcar3基因组中而获得。

3.根据权利要求1所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的HPV全基因组连入pcDNA3.1(+)骨架载体系统。

4.根据权利要求1所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的HPV全基因组包括高危型HPV全基因组与低危型HPV全基因组。

5.根据权利要求4所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的高危型HPV全基因组包括HPV16、HPV18、HPV26、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV45、HPV51、HPV52、HPV53、HPV56、HPV58、HPV59、HPV66、HPV68、HPV73、HPV82。

6.根据权利要求4所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的低危型HPV全基因组包括HPV6、HPV11、HPV42、HPV43、HPV44、HPV81、HPV83。

7.根据权利要求1所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品,其特征在于:

所述的质控品包括基因组DNA、细胞沉淀、细胞悬液。

8.一种用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品的制备方法,包括以下步骤:

(1)HPV基因组序列的合成;

(2)HPV质粒的转染;

(3)HPV单克隆筛选及鉴定;

(4)HPV不同拷贝数梯度质控品制备。

9.根据权利要求8所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品的制备方法,其特征在于:

步骤(1)中HPV基因组序列的两端添加酶切位点,其中5’端的酶切位点为NheI,其中3’端的酶切位点为PmeI;

步骤(2)中转染的方式如下:

通过酶切位点NheI、酶切位点PmeI分别连入pcDNA3.1(+)骨架载体,获得25种HPV分型质粒HPVx-pcDNA3.1(+),其中x表示具体HPV分型;将上述25种质粒分别转染ovcar3细胞,转染体系配置如下:

buffer:75μL,

HPVx-pcDNA3.1(+):1μg,

reagent:3.6μL,

将上述配置体系混匀,置于室温下静置10min,混匀后的体系加入提前接种ovcar3细胞系的12孔板中,培养箱中孵育4h-6h后更换正常培养基。

步骤(3)中单克隆筛选及鉴定的具体方法如下:

转染后24h,将细胞培养基换成包含抗生素的G418培养基,进行细胞的筛选;筛选结束后,将剩余的细胞进行单细胞克隆,消化并收集细胞、按照倍比稀释的方法,对细胞准确计数,用培养基将活细胞稀释至5个/mL,并将细胞充分混匀,取10mL细胞悬液,均匀分到一块96孔板中,每孔0.1mL;将细胞放至二氧化碳培养箱中,37℃培养,待细胞克隆形成时,标记有克隆的孔,加入胰蛋白酶消化细胞,取部分细胞作为扩增模板,分别使用引物对克隆进行扩增及sanger测序验证;剩余细胞扩大培养,备用;

步骤(4)中制备的方式如下:

选取HPV全基因组sanger测序验证的克隆,将克隆扩大培养,提取gDNA,采用数字PCR检测挑选的5个克隆中HPV的拷贝数;并以ddPCR鉴定拷贝数为参考,制备不同拷贝数的梯度质控品。

10.根据权利要求8所述的用于人乳头瘤病毒分子检测的质控品的制备方法,其特征在于:

利用上述步骤(4)中5种HPV整合细胞,分别制备成细胞悬液、细胞沉淀或gDNA形式质控品,HPV拷贝数为1E+02、1E+03、1E+04、1E+05。

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