[发明专利]水稻抽穗期QTL qHd1功能标记及其应用在审
| 申请号： | 202210743806.4 | 申请日： | 2022-06-27 |
| 公开（公告）号： | CN115044700A | 公开（公告）日： | 2022-09-13 |
| 发明（设计）人： | 赵雷;周少川;王重荣;李宏;黄道强;王志东;周德贵;陈宜波;龚蓉;潘阳阳;陈俊宇 | 申请（专利权）人： | 岭南现代农业科学与技术广东省实验室;广东省农业科学院水稻研究所;中国水稻研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人： | 齐宝玲 |
| 地址： | 510000 广东省广州市天河*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水稻 抽穗期 qtl qhd1 功能 标记 及其 应用 | ||
1.水稻抽穗期QTL qHd1功能标记，其特征在于，
所述共显性功能标记包括如下引物：
1F：5'-ggttttcccatgggtgtgat-3'，SEQ ID NO.1；
2F：5'-acatgcttaacctcatcacct-3'，SEQ ID NO.2；
1R：5'-acaccggtcatgatatgtgc-3'，SEQ ID NO.3；
3F：5'-tacatggggtggccatcata-3'，SEQ ID NO.4；
3R：5'-acttccatgataatgatgaggt-3'，SEQ ID NO.5。
2.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求1中所述引物。
3.权利要求1所述的水稻抽穗期QTL qHd1功能标记或权利要求2所述试剂盒在水稻种质资源鉴定中的应用。
4.权利要求1所述的水稻抽穗期QTL qHd1功能标记或权利要求2所述试剂盒在不同抽穗期水稻选育中的应用。
5.一种水稻品种基因型鉴定方法，其特征在于，
提取水稻DNA，利用权利要求1所述的水稻抽穗期QTL qHd1功能标记或权利要求2所述试剂盒对DNA进行PCR扩增，扩增产物进行电泳检测，通过带型分析水稻品种基因型。
6.根据权利要求5所述的一种水稻品种基因型鉴定方法，其特征在于，
结合水稻籼/粳类型鉴定水稻品种。
7.根据权利要求5所述的一种水稻品种基因型鉴定方法，其特征在于，
PCR扩增的反应体系为：2×Taq PCR Mix预混液10μL，模板DNA 2μL，H2O 6.8μL，引物1F、2F、3F、3R各0.2μL，引物1R 0.4μL。
8.根据权利要求5所述的一种水稻品种基因型鉴定方法，其特征在于，
PCR扩增的反应程序为：94℃5分钟；94℃30秒、55℃30秒、72℃30秒，35个循环；72℃5分钟。
9.根据权利要求5所述的一种水稻品种基因型鉴定方法，其特征在于，
所述水稻抽穗期QTL qHd1功能标记用于区分LOC_Os01g69850所示基因第一内含子序列自然变异的类型：
(1)缺失型：扩增获得的条带为228bp；
(2)插入型：扩增获得的条带为314bp；
(3)晶4155S型：扩增获得的条带为314bp+417bp；
(4)杂合型：扩增获得的条带为228bp+314bp或228bp+314bp+417bp。
10.根据根据权利要求9所述的一种水稻品种基因型鉴定方法，其特征在于，
所述插入型中，根据籼/粳类型区分籼稻和粳稻。
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