[发明专利]与中国南方荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记及其应用在审
| 申请号： | 202210686431.2 | 申请日： | 2021-01-28 |
| 公开（公告）号： | CN115141889A | 公开（公告）日： | 2022-10-04 |
| 发明（设计）人： | 程蕾;刘辰晖;胡修忠;向敏;余婕;周源;王定发;夏瑜 | 申请（专利权）人： | 武汉市农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司： | 武汉智权专利代理事务所(特殊普通合伙) 42225 | 代理人： | 马丽娜 |
| 地址： | 430000 湖北*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 中国南方 斯坦 奶牛 性状 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.第二SNP标记在辅助鉴定中国南方荷斯坦奶牛产奶性状中的用途，其特征在于：所述第二SNP标记位于中国南方荷斯坦奶牛基因组第18号染色体反链上第39037665bp处，碱基为G或A，第二SNP标记的GG基因型个体总奶量和高峰奶均显著高于GA基因型个体。
2.用于检测第二SNP标记的试剂盒在辅助鉴定中国南方荷斯坦奶牛产奶性状中的用途，其特征在于：所述用于检测第二SNP标记的试剂盒含有用于检测第二SNP标记的引物对和单碱基延伸引物；
所述第二SNP标记位于中国南方荷斯坦奶牛基因组第18号染色体反链上第39037665bp处，碱基为G或A，第二SNP标记的GG基因型个体总奶量和高峰奶均显著高于GA基因型个体；
所述引物对包括：
正向引物：5’-CCATACTCAGCCACAGCACAGC-3’，
反向引物：5’-GGGGCGAAATGAAAACTTCAACT-3’；
所述单碱基延伸引物为：
5’-TTTTTTTGTCGTCTTCCYTGTCGTGAAC-3’；
其中，核苷酸序列中的Y为简并碱基，代表C或T。
3.一种选育中国南方荷斯坦奶牛的方法，其特征在于：通过对待测中国南方荷斯坦奶牛进行第二SNP标记的检测，评估所述待测中国南方荷斯坦奶牛的产奶性状，选择具有能够提高产奶量的优势等位基因和基因型的个体开展选育工作；所述第二SNP标记位于中国南方荷斯坦奶牛基因组第18号染色体反链上第39037665bp处，碱基为G或A，第二SNP标记的GG基因型个体总奶量和高峰奶均显著高于GA基因型个体。
4.根据权利要求3所述的选育中国南方荷斯坦奶牛的方法，其特征在于，包括以下步骤：
提取待测中国南方荷斯坦奶牛的基因组DNA；
以待测中国南方荷斯坦奶牛的基因组DNA为模板，利用引物对进行多重PCR扩增反应；所述引物对包括：
正向引物：5’-CCATACTCAGCCACAGCACAGC-3’，
反向引物：5’-GGGGCGAAATGAAAACTTCAACT-3’；
利用第二SNP标记的单碱基延伸引物对PCR扩增产物进行单碱基延伸反应，延伸产物测序，确定第二SNP标记基因型，选择目标基因型的个体培育产奶优势品种；所述第二SNP标记的单碱基延伸引物为：
5’-TTTTTTTGTCGTCTTCCYTGTCGTGAAC-3’；
其中，核苷酸序列中的Y为简并碱基，代表C或T。
5.根据权利要求4所述的选育中国南方荷斯坦奶牛的方法，其特征在于：用于杂交育种的亲本之一至少符合以下条件：第二SNP标记含有等位基因G。
6.根据权利要求5所述的选育中国南方荷斯坦奶牛的方法，其特征在于：选择第一SNP标记为CC基因型且第二SNP标记为GG基因型的个体作为产奶性状的优势个体；所述第一SNP标记位于中国南方荷斯坦奶牛基因组第18号染色体反链上第39037752bp处，碱基为C或T，第一SNP标记的CC基因型个体的305d奶量极显著高于CT基因型个体和TT基因型个体，总奶量和高峰奶均显著高于CT基因型个体和TT基因型个体。
7.根据权利要求3～6任一项所述的选育中国南方荷斯坦奶牛的方法，其特征在于：所述中国南方荷斯坦奶牛为武汉地区荷斯坦奶牛。
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