[发明专利]痰液标本无细胞上清游离DNA二代测序建库、检测方法在审
申请号: | 202210678914.8 | 申请日: | 2022-06-16 |
公开(公告)号: | CN115011668A | 公开(公告)日: | 2022-09-06 |
发明(设计)人: | 王征;刘东戈;王逸菲;李琳;李晓光;崔娣;杨丽;邸婧;何磊;孙铭君 | 申请(专利权)人: | 北京医院 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C40B50/06;C12Q1/6869;C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 王灏增 |
地址: | 100730 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 标本 细胞 游离 dna 二代 测序建库 检测 方法 | ||
1.一种痰液标本cfDNA二代测序建库方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取、质控:对痰液标本进行化痰处理,离心,从上清液中提取痰液标本的cfDNA,对所述cfDNA进行浓度检测;
2)构建文库:使用基因二代测序检测试剂盒进行痰液标本的cfDNA文库的构建,得二代测序的痰液标本的cfDNA的基因测序文库。
2.如权利要求1所述痰液标本cfDNA二代测序建库方法,其特征在于,所述步骤1)中化痰处理的方法为:粘稠型痰液标本加入1:2-3体积生理盐水,依次加入2ml 0.5mol/L DTT,观察化痰效果,直至化痰完全;水样痰液加入1:1生理盐水后,依次加入2ml 0.5mol/L DTT,观察化痰效果,直至化痰完全。
3.如权利要求2所述痰液标本cfDNA二代测序建库方法,其特征在于,每次加入DTT溶液后,震荡5min,再观察化痰效果。
4.如权利要求2所述痰液标本cfDNA二代测序建库方法,其特征在于,所述步骤1)的痰液标本至少为3ml。
5.如权利要求2所述痰液标本cfDNA二代测序建库方法,其特征在于,所述离心条件为转速1500g,时间5min。
6.如权利要求2所述痰液标本cfDNA二代测序建库方法,其特征在于,所述步骤1)中的痰液标本在进行化痰处理前置于固定液中保存或者运送,所述固定液为50%乙醇和聚乙二醇400的混合液,所述50%乙醇和聚乙二醇400的体积比为49:1。
7.一种痰液标本cfDNA提取方法,其特征在于,所述痰液标本cfDNA用于构建二代测序的cfDNA的基因测序文库,包括如下步骤:
1)对收集到的痰液标本进行化痰处理,得到化痰完全的痰液标本;
2)将化痰完全的痰液标本,离心,转速1500g,时间5min;
3)取离心后上清液,提取痰液标本的cfDNA。
8.根据权利要求7所述方法,其特征在于,所述化痰处理的方法为:粘稠型痰液标本加入1:2-3体积生理盐水,依次加入2ml 0.5mol/L DTT,观察化痰效果,直至化痰完全;水样痰液加入1:1生理盐水后,依次加入2ml 0.5mol/L DTT,观察化痰效果,直至化痰完全;在进行化痰处理前,痰液标本置于固定液中保存,所述固定液为50%乙醇和聚乙二醇400的混合液,所述50%乙醇和聚乙二醇400的体积比为49:1。
9.一种痰液标本cfDNA二代测序检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含有用权利要求1-6任一项所述建库方法制备的DNA测序文库。
10.根据权利要求9所述的痰液标本cfDNA二代测序检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒使用时的痰液标本cfDNA的起始投入量为150ng。
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