[发明专利]一种花叶海棠SSR标记的开发和应用

说明书

本发明公开了一种花叶海棠SSR标记的开发和应用。本发明提供了用于检测花叶海棠的SSR引物组合由18个引物对中的全部或部分组成，所述部分为2个以上17个以下。18个引物对是从根据花叶海棠转录组测序数据设计的10730组引物中筛选出来的。实验证明本发明由这18个引物对组成的SSR引物组合能有效的对花叶海棠群体进行遗传多样性分析。本发明对于构建花叶海棠遗传图谱和种质鉴定具有重要意义。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种花叶海棠SSR标记的开发和应用。

背景技术

SSR分子标记也叫微卫星，是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列，通常是一种用1-6个寡核苷酸组成的简单重复序列，它的两端是保守的单拷贝序列，常用的手段是在序列的两端设计并连接一对特异性引物。SSR标记具有共显性的特点，大多数情况下微卫星在生物的基因组中分布，变异位点中包含很多遗传基因，这样的标记方法多态性稳定且重复率高，操作便利，灵敏度好。由于重复单位的重复次数在个体间高度变异，数量丰富，因此微卫星标记有广泛的应用性。利用SSR标记的方法可以对品种和种群之间的多样性进行评价的研究，也可以应用到遗传图谱的构建和种质的鉴定等方面。

花叶海棠(学名：Malus transitoria(Batalin)C.K.Schneid.)是蔷薇科苹果属植物。同时兼具食用、药用和观赏价值。目前在针对花叶海棠的种质研究以及遗传多态性分析中没有相关的引物信息发表。

发明内容

本发明的目的是提供一种花叶海棠SSR标记的开发和应用。

第一方面，本发明要求保护一种用于检测花叶海棠的SSR引物组合。

本发明所要求保护的用于检测花叶海棠的SSR引物组合，由如下18个引物对中的全部或部分组成，所述部分为2个以上17个以下：

引物对1：由SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的两条单链DNA组成；

引物对2：由SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的两条单链DNA组成；

引物对3：由SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的两条单链DNA组成；

引物对4：由SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示的两条单链DNA组成；

引物对5：由SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示的两条单链DNA组成；

引物对6：由SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示的两条单链DNA组成；

引物对7：由SEQ ID No.13和SEQ ID No.14所示的两条单链DNA组成；

引物对8：由SEQ ID No.15和SEQ ID No.16所示的两条单链DNA组成；

引物对9：由SEQ ID No.17和SEQ ID No.18所示的两条单链DNA组成；

引物对10：由SEQ ID No.19和SEQ ID No.20所示的两条单链DNA组成；

引物对11：由SEQ ID No.21和SEQ ID No.22所示的两条单链DNA组成；

引物对12：由SEQ ID No.23和SEQ ID No.24所示的两条单链DNA组成；

引物对13：由SEQ ID No.25和SEQ ID No.26所示的两条单链DNA组成；

引物对14：由SEQ ID No.27和SEQ ID No.28所示的两条单链DNA组成；

引物对15：由SEQ ID No.29和SEQ ID No.30所示的两条单链DNA组成；