[发明专利]一种花叶海棠SSR标记的开发和应用在审
| 申请号: | 202210654426.3 | 申请日: | 2022-06-10 |
| 公开(公告)号: | CN114836417A | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
| 发明(设计)人: | 张得芳;夏涛;王占林 | 申请(专利权)人: | 青海省农林科学院 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张立娜 |
| 地址: | 810016 *** | 国省代码: | 青海;63 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 花叶 海棠 ssr 标记 开发 应用 | ||
1.用于检测花叶海棠的SSR引物组合,由如下18个引物对中的全部或部分组成,所述部分为2个以上17个以下:
引物对1:由SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的两条单链DNA组成;
引物对2:由SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的两条单链DNA组成;
引物对3:由SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的两条单链DNA组成;
引物对4:由SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示的两条单链DNA组成;
引物对5:由SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示的两条单链DNA组成;
引物对6:由SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示的两条单链DNA组成;
引物对7:由SEQ ID No.13和SEQ ID No.14所示的两条单链DNA组成;
引物对8:由SEQ ID No.15和SEQ ID No.16所示的两条单链DNA组成;
引物对9:由SEQ ID No.17和SEQ ID No.18所示的两条单链DNA组成;
引物对10:由SEQ ID No.19和SEQ ID No.20所示的两条单链DNA组成;
引物对11:由SEQ ID No.21和SEQ ID No.22所示的两条单链DNA组成;
引物对12:由SEQ ID No.23和SEQ ID No.24所示的两条单链DNA组成;
引物对13:由SEQ ID No.25和SEQ ID No.26所示的两条单链DNA组成;
引物对14:由SEQ ID No.27和SEQ ID No.28所示的两条单链DNA组成;
引物对15:由SEQ ID No.29和SEQ ID No.30所示的两条单链DNA组成;
引物对16:由SEQ ID No.31和SEQ ID No.32所示的两条单链DNA组成;
引物对17:由SEQ ID No.33和SEQ ID No.34所示的两条单链DNA组成;
引物对18:由SEQ ID No.35和SEQ ID No.36所示的两条单链DNA组成。
2.用于检测花叶海棠的SSR引物,为权利要求1中所述18个引物对中的任意一个。
3.用于检测花叶海棠的SSR标记组合,由18个SSR标记中的全部或部分组成,所述部分为2个以上17个以下;所述18个SSR标记为以花叶海棠基因组DNA为模板,分别采用权利要求1中所述18个引物对进行PCR扩增后所得的18份扩增产物序列。
4.用于检测花叶海棠的SSR标记,为权利要求3中所述18个SSR标记中的任意一个。
5.用于检测花叶海棠的试剂盒,含有权利要求1所述的SSR引物组合或权利要求2所述的SSR引物。
6.权利要求1所述的SSR引物组合或权利要求2所述的SSR引物或权利要求3所述的SSR标记组合或权利要求4所述的SSR标记或权利要求5所述的试剂盒在如下任一中的应用:
(A1)对花叶海棠进行遗传多样性检测;
(A2)对花叶海棠进行遗传图谱构建;
(A3)对花叶海棠进行种质鉴定。
7.一种对花叶海棠进行遗传多样性检测的方法,包括如下步骤:
(B1)分别以不同待测花叶海棠基因组DNA为模板,采用权利要求1所述的SSR引物组合或权利要求2所述的SSR引物进行PCR扩增,得到扩增产物;
(B2)将所述扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据所述不同待测花叶海棠间的条带多态性进行花叶海棠进行遗传多样性分析。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:步骤(B1)中,进行所述PCR扩增时,组成所述引物对的两条单链DNA分子和作为模板的花叶海棠基因组DNA的配比为5pmol:5pom:125ng。
9.根据权利要求7或8所述的方法,其特征在于:步骤(B1)中,进行所述PCR扩增时,组成所述引物对的两条单链DNA分子在反应体系中的终浓度均为0.5μmol/L;作为模板的花叶海棠基因组DNA在反应体系中的终浓度为12.5ng/μL。
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