[发明专利]一种利用酚氯仿法纯化RNA的方法在审
申请号: | 202210569028.1 | 申请日: | 2022-05-24 |
公开(公告)号: | CN114891782A | 公开(公告)日: | 2022-08-12 |
发明(设计)人: | 贺力;王宁;李恒宽;王梽名;张林珍;熊筱萱 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 重庆信必达知识产权代理有限公司 50286 | 代理人: | 李小伟 |
地址: | 625000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 氯仿 纯化 rna 方法 | ||
1.一种利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法包括:通过酚氯仿法优化实验步骤,通过变性作用抑制RNase A和DNase I活性,除去RNaseA和DNase I后获得纯化的RNA双链。
2.如权利要求1所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法包括以下步骤:
步骤一,利用Trizol试剂提取总RNA;
步骤二,通过添加DNase I试剂去除基因组DNA;
步骤三,在反应体系中加入RNaseA去除单链RNA;
步骤四,利用酚氯仿法纯化dsRNA;
步骤五,对纯化的dsRNA进行反转录反应;
步骤六,设计特异性引物并进行PCR扩增;
步骤七,进行琼脂糖凝胶电泳。
3.如权利要求2所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述步骤一中的提取总RNA包括:
利用Trizol试剂进行总RNA提取,对获得的RNA进行质量分析和浓度检测,选择质量合格的样品进行后续分析。
4.如权利要求2所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述步骤二中的去除基因组DNA包括:
通过添加1μL DNase I试剂去除RNA样品中的基因组DNA,在37℃下反应30min;
所述步骤三中的去除单链RNA包括:
向步骤二的反应体系中加入2μL RNase A去除反应体系中的单链RNA,将反应体系在37℃下反应60min。
5.如权利要求4所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述DNase I的浓度为3units/μL,所述RNase A的浓度为20μg/μL。
6.如权利要求2所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述步骤四中的纯化dsRNA包括:
(1)对反应产物通过酚氯仿法进行RNA的纯化;加入200μL氯仿试剂,上下震荡15s,而后室温静置3min;
(2)12000g,4℃,离心15min,离心后溶液分为可见的二层,吸取上层无色水相到新的离心管;
(3)每管加入500μL异丙醇试剂,颠倒混匀后,室温静置10min;
(4)12000g,4℃,离心10min,离心后管底出现少量絮状沉淀,弃上清;
(5)加入1mL 75%乙醇溶液,轻轻颠倒混匀后,7500g,4℃,离心5min,离心后弃上清,并在冰上干燥5~10min;
(6)向RNA沉淀中加入30μL RNase Free水,用移液枪轻轻吹打混匀。
7.如权利要求2所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述步骤五中的dsRNA反转录包括:
基于All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR,对纯化的RNA产物进行反转录反应。
8.如权利要求2所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述步骤六中的设计特异性引物并进行PCR扩增包括:
利用Primer 5.0软件针对AS lncRNA与正义基因的互补与非互补重叠区域分别设计特异性引物;通过High Fidelity PCR SuperMix分别对互补与非互补重叠的区域进行PCR扩增,按94℃预变性3min,重复35个循环,72℃5min终止延伸的反应条件进行。
9.如权利要求8所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述PCR扩增条件为:94℃变性30sec,50~60℃退火30sec,72℃延伸1min。
10.如权利要求2所述利用酚氯仿法纯化RNA的方法,其特征在于,所述所述步骤七中的琼脂糖凝胶电泳包括:
制作2%的琼脂糖凝胶,将PCR产物加到点胶孔,在120V电压环境下跑胶进行产物的检测,并在Bio-rad凝胶成像分析系统拍照记录。
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