[发明专利]一种鉴定雌性克氏原螯虾的SSR标记及其应用在审
申请号: | 202210523775.1 | 申请日: | 2022-05-13 |
公开(公告)号: | CN114959056A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 白旭峰;谭云飞;蓬国辉;邢永忠;彭波;孙俊霄 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6879;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 张红兵 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 雌性 克氏原螯虾 ssr 标记 及其 应用 | ||
1.一种SSR标记在雌性克氏原螯虾鉴定中的应用,其特征在于,所述的应用包括下列步骤:
1)分别提取雌、雄性克氏原螯虾基因组DNA,每个性别样本至少提取150尾;
2)设计引物:根据克氏原螯虾基因组测序数据,利用Primer3软件设计正向引物PCM1237-F 5'-CGCACACTTCTTCACCCTCT-3'和反向引物PCM1237-R 5'-AGGAGTCTTTTAACATGAGAGATTTT-3';
3)对雌、雄群体克氏原螯虾的DNA样本进行PCR检测:
以正向引物PCM1237-F 5'-CGCACACTTCTTCACCCTCT-3',和反向引物PCM1237-R 5'-AGGAGTCTTTTAACATGAGAGATTTT-3'扩增目的片段,利用琼脂糖电泳检测目的片段是否被扩增出;
4)利用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测并进行统计分析:将扩增出的PCR产物用4%的聚丙烯酰胺凝胶进行电泳检测,电泳胶板用0.2%的硝酸银溶液进行染色,用含有0.5%甲醛溶液的0.5M氢氧化钠溶液进行显影、漂洗和晾干,对上述各个群体进行带型统计分析;
5)检测到雌性和雄性克氏原螯虾群体样本,显示所有雌性或雄性样本在PCM1237位点是否含有A、B、C三种等位基因,判定雌性克氏原螯虾基因型为纯合型或杂合型,判定雄性克氏原螯虾基因型仅为纯合型,判定杂合型为雌性克氏原螯虾;
PCR条件:95℃预变性3min;95℃变性30s;58℃退火30s;72℃延伸30s;35次循环后;72℃再延伸7min;4℃保存。
2.一种SSR标记在雌性克氏原螯虾鉴定中的应用,其特征在于,所述的应用还包括用SSR标记特异鉴定和筛选雌性克氏原螯虾。
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