[发明专利]一种针对糜子GBSSI基因开发的功能标记

权利要求书

1.一组用于糜子基因分型的SNP-CAPS分子标记，其特征在于，所述SNP-CAPS分子标记包括RYW215和RYW216；

针对RYW215设计的引物对包括Int5Lf和R3，所述Int5Lf的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述R3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；

针对RYW216设计的引物对包括M12和R12，所述M12的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述R12的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。

2.根据权利要求1所述SNP-CAPS分子标记，其特征在于，所述Int5Lf和R3的扩增片段为223bp，当SNP位点存在A替换G时，扩增片段能被ACCI酶切产生171bp和52bp两个片段；

所述M12和R12的扩增片段为645bp，当SNP位点存在插入A导致移码突变时，扩增片段能被EcoNI酶切产生359bp和286bp两个片段。

3.一种针对糜子GBSSI基因开发的功能标记，其特征在于，包括InDel分子标记和权利要求1或2所述SNP-CAPS分子标记；

所述InDel分子标记包括RYW214，针对RYW214设计的2对嵌套引物包括：M5QT1和R11QT1组成的引物对及M5QT2和R11QT2组成的引物对；所述M5QT1的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，R11QT1的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示，所述M5QT2的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述R11QT2的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。

4.根据权利要求3所述功能标记，其特征在于，还包括针对RYW214设计的常规引物对M5和R11，其中M5的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示，R11的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。

5.一种检测针对糜子GBSSI基因开发的功能标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括针对权利要求3或4所述功能标记设计的引物。

6.权利要求1或2所述SNP-CAPS分子标记或权利要求3或4所述功能标记或权利要求5所述试剂盒在预测糜子直链淀粉含量中的应用。

7.权利要求1或2所述SNP-CAPS分子标记或权利要求3或4所述功能标记或权利要求5所述试剂盒在区分糜子粳糯表型中的应用。

8.权利要求1或2所述SNP-CAPS分子标记或权利要求3或4所述功能标记或权利要求5所述试剂盒在培育糜子新品种中的应用。