[发明专利]与水稻籽粒暗胚乳性状相关的SSCP分子标记、基因及其应用

权利要求书

1.一种与水稻籽粒暗胚乳性状相关的SSCP分子标记，其特征在于，所述SSCP分子标记的碱基序列如SEQ ID NO.1所示，SSCP位点位于扩增片段的第91bp处，碱基差异为A/G。

2.如权利要求1所述的与水稻籽粒暗胚乳性状相关的SSCP分子标记，其特征在于，用于扩增所述SSCP分子标记的引物对序列，如下所示：

上游引物F为：5’-GTGGAGGAAACCGATGGAGA-3’；

下游引物R为：5’-CTAGGCTGGGAACGTTGGG-3’；

扩增产物为158bp，序列如SEQ ID NO.1所示，SSCP位点位于扩增片段的第91bp处。

3.OsDE6基因在调控水稻籽粒胚乳品质中的应用，其特征在于，所述OsDE6基因开放阅读框架的碱基序列如SEQ ID NO.2所示。

4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述水稻籽粒胚乳品质的表征指标为胚乳表型、直链淀粉含量、总淀粉含量和总蛋白质含量。

5.一种用于扩增权利要求1所述SSCP分子标记的引物对，其特征在于，序列如下所示：

上游引物F为：5’-GTGGAGGAAACCGATGGAGA-3’；

下游引物R为：5’-CTAGGCTGGGAACGTTGGG-3’。

6.如权利要求4所述的引物对在水稻分子标记辅助育种中的应用。

7.如权利要求3所述的OsDE6基因或权利要求5所述的引物对在筛选不同水稻籽粒品质的种质资源中的应用。

8.如权利要求7所述的应用，其特征在于，所述水稻籽粒胚乳品质的表征指标为胚乳表型、直链淀粉含量、总淀粉含量和总蛋白质含量。

9.如权利要求7所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：

(1)将待筛选水稻植株与突变体de6杂交后获得F₁，F₁进行自交，构建得到F₂群体；所述突变体de6的6号染色体RM340标记和RM439标记之间如SEQ ID NO.2所示碱基序列的第80bp处碱基由A突变为G；

(2)取F₂群体植株的基因组DNA，采用SSCP分子标记方法进行筛选；

筛选规则为：当条带为野生型或者父本一致时，则判定为AA；当条带为de6突变体一致时，则判定为aa；当条带兼有两种类型，则判定为Aa。