[发明专利]细胞数据注释方法、装置、设备及介质

说明书

本申请公开了一种细胞数据注释方法、装置、设备及存储介质，该方法包括：获取待预测转录组的细胞数据；细胞数据包括待预测转录组中多个测序点的基因表达信息以及多个测序点的空间信息；确定与待预测转录组对应的已注释细胞对象，根据细胞对象以及基因表达信息确定待预测转录组的初始细胞注释结果；将细胞数据输入第一预测模型，根据第一预测模型的输出与初始细胞注释结果之间的损失对初始细胞注释结果进行修正，获得待预测转录组的细胞注释结果。该技术方案能够基于特征较为全面的细胞数据获得待预测转录组的细胞注释结果，从而提高了空间转录组的细胞注释结果的准确性。

技术领域

本发明一般涉及生物信息分析技术领域，具体涉及一种细胞数据注释方法、装置、设备及介质。

背景技术

随着生物信息技术的不断发展，空间转录组技术已经广泛应用到各类医学研究中，例如肿瘤研究、神经科学、发育生物学、分子病理学等不同领域。在医学研究过程中，为了基于空间转录组细胞数据进行基因差异表达分析、细胞发育轨迹分析、基因本体(GeneOntology，GO)富集分析等研究，需要对空间转录组细胞数据进行细胞注释。

目前，相关技术中可以采用分类训练的方法基于参考数据集构建模型，然后通过采用构建的模型预测待注释数据集的细胞类型。

然而该方法在判断细胞类型的过程中所利用的参考数据集存在特征片面的问题，这也就导致对细胞类型注释的准确度较低。

发明内容

鉴于现有技术中的上述缺陷或不足，期望提供一种细胞数据注释方法、装置、设备及介质，能够基于特征较为全面的细胞数据获得待预测转录组的细胞注释结果，从而提高了空间转录组的细胞注释结果的准确性。所述技术方案如下：

根据本申请的一个方面，提供了一种细胞数据注释方法，该方法包括：

获取待预测转录组的细胞数据；所述细胞数据包括所述待预测转录组中多个测序点的基因表达信息以及所述多个测序点的空间信息；

确定与所述待预测转录组对应的已注释细胞对象，根据所述细胞对象以及所述基因表达信息确定所述待预测转录组的初始细胞注释结果；

将所述细胞数据输入第一预测模型，根据所述第一预测模型的输出与所述初始细胞注释结果之间的损失对所述初始细胞注释结果进行修正，获得所述待预测转录组的细胞注释结果。

根据本申请的另一方面，提供了一种细胞数据注释装置，该装置包括：

获取模块，用于获取待预测转录组的细胞数据；所述细胞数据包括所述待预测转录组中多个测序点的基因表达信息以及所述多个测序点的空间信息；

处理模块，用于确定与所述待预测转录组对应的已注释细胞对象，根据所述细胞对象以及所述基因表达信息确定所述待预测转录组的初始细胞注释结果；

细胞注释模块，用于将所述细胞数据输入第一预测模型，根据所述第一预测模型的输出与所述初始细胞注释结果之间的损失对所述初始细胞注释结果进行修正，获得所述待预测转录组的细胞注释结果。

根据本申请的另一方面，提供了一种计算机设备，包括存储器、处理器以及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序，该处理器执行该程序时实现如上述的细胞数据注释方法。

根据本申请的另一方面，提供了一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，该计算机程序用于实现如上述的细胞数据注释方法。

根据本申请的另一方面，提供了一种计算机程序产品，其上包括指令，该指令被执行时实现如上述的细胞数据注释方法。