[发明专利]细胞数据注释方法、装置、设备及介质在审
申请号: | 202210442634.7 | 申请日: | 2022-04-25 |
公开(公告)号: | CN115116549A | 公开(公告)日: | 2022-09-27 |
发明(设计)人: | 吴子涵;姚建华 | 申请(专利权)人: | 腾讯科技(深圳)有限公司 |
主分类号: | G16B50/10 | 分类号: | G16B50/10;G16B25/10;G16B40/00;G16B20/30 |
代理公司: | 北京励诚知识产权代理有限公司 11647 | 代理人: | 熊金凤 |
地址: | 518057 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细胞 数据 注释 方法 装置 设备 介质 | ||
1.一种细胞数据注释方法,其特征在于,包括:
获取待预测转录组的细胞数据;所述细胞数据包括所述待预测转录组中多个测序点的基因表达信息以及所述多个测序点的空间信息;
确定与所述待预测转录组对应的已注释细胞对象,根据所述细胞对象以及所述基因表达信息确定所述待预测转录组的初始细胞注释结果;
将所述细胞数据输入第一预测模型,根据所述第一预测模型的输出与所述初始细胞注释结果之间的损失对所述初始细胞注释结果进行修正,获得所述待预测转录组的细胞注释结果。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞对象以及所述基因表达信息确定所述待预测转录组的初始细胞注释结果,包括:
确定与所述细胞对象匹配的第二预测模型;所述第二预测模型是待预测转录组的基于所述细胞对象的历史基因表达信息以及所述历史基因表达信息对应的历史细胞注释结果进行训练获得的;
将所述基因表达信息输入所述第二预测模型,获得所述待预测转录组的初始细胞注释结果。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述细胞对象为所述待预测转录组对应的基因测序对象包括的单细胞或细胞组。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述将所述细胞数据输入第一预测模型,根据所述第一预测模型的输出与所述初始细胞注释结果之间的损失对所述初始细胞注释结果进行修正,获得所述待预测转录组的细胞注释结果,包括:
将所述细胞数据输入所述第一预测模型进行编码处理得到融合编码信息,将所述融合编码信息输入所述第一预测模型的分类模块,获得所述第一预测模型的输出结果;
根据所述第一预测模型的损失函数确定所述输出结果和所述初始细胞注释结果之间的损失,根据所述损失迭代训练所述分类模块,在所述损失函数最小化时获得调整后的所述第一预测模型;
将所述细胞数据输入调整后的所述第一预测模型,获得所述待预测转录组的细胞注释结果。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述将所述细胞数据输入所述第一预测模型进行编码处理包括:
将所述基因表达信息输入所述第一预测模型的第一编码模块,获得第一编码信息;
根据所述空间信息确定邻接矩阵;所述邻接矩阵用于表征所述待预测转录组中各个测序点的邻近测序点;
将所述邻接矩阵和所述第一编码信息输入所述第一预测模型的第二编码模块进行处理,获得第二编码信息;
将所述第一编码信息和所述第二编码信息进行融合处理,得到所述融合编码信息。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在得到所述融合编码信息之后,所述方法还包括:
对所述融合编码信息进行解码处理,获得重构的基因表达信息;
根据所述损失函数确定所述重构的基因表达信息与所述基因表达信息之间的损失,根据所述损失调整所述第一编码模块的参数,使得所述重构的基因表达信息接近所述基因表达信息。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,对所述融合编码信息进行解码处理,获得重构的解码信息,包括:
对所述融合编码信息进行线性特征提取处理,得到中间特征信息;
将所述中间特征信息输入第一解码器进行特征还原处理,获得所述重构的基因表达信息。
8.根据权利要求4-7任一项所述的方法,其特征在于,在得到所述融合编码信息之后,所述方法还包括:
对所述融合编码信息进行解码处理,获得重构的空间信息;
根据所述损失函数确定所述重构的空间信息与所述空间信息之间的损失,根据所述损失调整所述第二编码模块的参数,使得所述重构的空间信息接近所述空间信息。
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