[发明专利]一种血液游离DNA甲基化定量检测方法及其应用在审
| 申请号： | 202210399036.6 | 申请日： | 2022-04-15 |
| 公开（公告）号： | CN114703284A | 公开（公告）日： | 2022-07-05 |
| 发明（设计）人： | 徐建锋;张超;李典格;李清华;张泽跃 | 申请（专利权）人： | 北京莱盟君泰国际医疗技术开发有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6869;G16B25/20;G16B40/10;G16B20/20;G16B50/30 |
| 代理公司： | 成都顶峰专利事务所(普通合伙) 51224 | 代理人： | 钱学宇 |
| 地址： | 100000 北京市北京经*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 血液 游离 dna 甲基化 定量 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种血液游离DNA甲基化定量检测方法，其特征在于，所述检测方法包括：
(1)基底离体样本基因组甲基化值：获取基底离体样本基因组DNA，进行预处理；计算基底离体样本基因组中CpG位点的甲基化值，标记为A1；
(2)待测样本的甲基化值：计算待测样本的血液游离DNA中CpG位点甲基化值，标记为A2；检测待测样本的血液游离DNA片段数目，标记为A3；
(3)cfDNA绝对甲基化值：计算(A2-A1)×A3，得到cfDNA绝对甲基化值。
2.根据权利要求1所述的血液游离DNA甲基化定量检测方法，其特征在于，所述步骤(1)中，基底离体样本基因组为健康人类离体血液提取出白细胞的基因组样本。
3.根据权利要求1所述的血液游离DNA甲基化定量检测方法，其特征在于，所述步骤(1)中，预处理包括将健康人类离体白细胞基因组DNA片段打断、筛选、甲基化建库以及二代测序的处理过程。
4.根据权利要求3所述的血液游离DNA甲基化定量检测方法，其特征在于，所述步骤(1)中，DNA片段大小为150-200bp。
5.根据权利要求1所述的血液游离DNA甲基化定量检测方法，其特征在于，所述步骤(2)中，检测待测样本的血液游离DNA片段数为以二代测序法测序结果进行统计，获得每个区域的片段数目。
6.根据权利要求1所述的血液游离DNA甲基化定量检测方法，其特征在于，所述步骤(3)中，cfDNA绝对甲基化值为评估待测样本中肿瘤来源的发生甲基化的cfDNA的数目。
7.一种如权利要求1-6任一项所述的检测方法在cfDNA甲基化肿瘤标记物筛选中的应用。
8.根据权利要求7所述的血液游离DNA甲基化定量检测方法的应用，其特征在于，所述筛选的标准值为cfDNA绝对甲基化值。
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