[发明专利]一组用于近视诊断及右眼柱镜筛查的SNP组合标志物及其应用

说明书

本发明属于生物医药领域，涉及一组用于近视诊断及右眼柱镜筛查的SNP组合标志物及其应用。本发明利用人工智能方法分析近视眼人群和正常人群SNP位点基因频率存在差异的SNP位点对近视的诊断效能。本发明的近视诊断模型可有效识别近视人群或存在近视风险的人群。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及一组用于近视诊断及右眼柱镜筛查的SNP组合标志物及其应用。

背景技术

眼科疾病是指发生在眼部区域的疾病，常见眼科疾病有近视、散光、白内障、青光眼、中心浆液性视网膜病变、干眼症、交感性眼炎、夜盲症、弱视、沙眼、糖尿病视网膜病变、结膜炎、老花眼、色盲、视网膜色素变性、视网膜中央动脉阻塞、视网膜脱落、远视、针眼、雪盲症、霰粒肿、飞蚊症等。在调节放松的状态下，平行光线经眼球屈光系统后聚焦在视网膜之前，称为近视。

屈光度是指屈光不正状态下所产生的度数大小，当屈光度发生时，一般多代表近视、散光、远视或是弱视等临床表现，近视、远视通常为球镜(S)，散光为柱镜(C)，目前采用等效球镜度数(Spherical Equivalent Refraction，SE)评价屈光度，等效球镜度数＝球镜度数+散光度数*1/2。屈光度≤-0.50D可作为近视诊断的循证共识阈值。更具体地，近视的定义是当调节放松时，眼睛的等效球镜屈光不正≤-0.5D的情况。高度近视的定义是当调节放松时，眼睛的等效球镜屈光不正≤-6.00D的情况。低度近视的定义是当调节放松时，眼睛的等效球镜屈光不正≤-0.5且-6.00D的情况。

近视作为一种全球高发性疾病近年来受到国内外越来越多的关注，预计到2050年，近视将影响到全球近50％的人口，同时高度近视也将影响到全球近10％的人口。

同时，近视也是目前影响我国青少年人群视觉健康的主要眼病，其中高度近视是引起我国眼病患者眼盲和低视力的主要原因之一，将给患者及其家庭带来严重的经济负担。对于孩子视力问题，预防很重要，而早发现、早干预、早治疗，是防止近视度数加深的关键。少年儿童时期的眼病对视力发育危害极大，及早发现和诊断影响视力的非屈光不正性眼病非常重要，许多的眼病如果不能得到及时的发现和治疗，将造成眼睛的终生残疾。虽然通过药物、光学治疗和行为矫正可以部分减缓其加深速度，但我们距离能够逆转过去几十年的趋势还有很长的路要走。这使得近视及其相关并发症成为了研究的重中之重。高度近视的发生涉及多因素复杂过程，发病机制仍不清楚，当下的各种光学矫正手段以及手术治疗方法，如屈光手术和巩膜加固手术，不能从根本上阻止及延缓高度近视眼底病变的发展，可以说目前缺乏行之有效的高度近视的治疗措施。由此可见，寻找更有效的方法对高度近视患者和高危人群进行早期检测、风险预测和早期干预具有重要的临床意义。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，snp)是指在基因组水平上单个碱基的转换、颠换或由碱基的插入、缺失引起核苷酸变异导致的DNA序列多态性，是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的80％以上，人群中变异频率高于1％，这也是区别于点突变的一个重要因素。在遗传学分析中，SNPs具有高频、稳定和易分析等特点。研究发现，SNPs与近视的发生发展具有较强的关联性。SNPs检测主要方法有时间飞行质谱(MALDI-TOFMS)技术、荧光定量PCR技术、基因芯片技术、变形高效液相色谱等。

随着高通量SNP检测技术方法的出现，作为数量最多且易于批量检测的多态标记，SNP在连锁分析与基因定位，包括复杂疾病的基因定位、关联分析、个体和群体对环境致病因子与药物的研究中将发挥愈来愈重要的作用。随着技术的发展，SNP检测费用也越来越经济，SNP标志物将成为新一代分子标记。

发明内容

本发明提供了一种诊断近视的SNP位点，所述SNP位点包括以下任一组的位点组合：

1)rs42688、rs143580489、rs10484690、rs189212243；