[发明专利]一种基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法在审
申请号: | 202210363235.1 | 申请日: | 2022-04-07 |
公开(公告)号: | CN114839381A | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 冯致远;张晶晶 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N33/58;C12N15/115;C12N15/113 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 冒艳 |
地址: | 210023 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr cas13d 检测 心肌 肌钙蛋白 方法 | ||
1.一种基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)基于标记有cTnI抗体的酶标板,结合待测物中的cTnI,孵育形成抗体-cTnI复合物;
(2)两条ssDNA退火形成双链cTnI DNA适配体;
(3)适配体与cTnI-抗体复合物孵育,结合形成抗体-cTnI-适配体三元夹心结构;
(4)抗体-cTnI-适配体三元夹心结构与T7 RNA聚合酶Mix混合,通过识别双链DNA适配体的T7启动子序列启动转录合成激活子RNA;
(5)CRISPR Cas13d蛋白与crRNA按比例混合,锚定形成Cas-crRNA核糖核酸复合物;
(6)向步骤(4)的产物中加入核糖核酸复合物和荧光信号报告分子,Cas-crRNA核糖核酸复合物可特异性识别激活子RNA,激活Cas蛋白的侧切活性并切割荧光报告分子,检测相关动力学和终点荧光值。
2.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:
crRNA-F:TAATACGACTCACTATAGGCACTGGTGCAA
SEQ ID NO.1ATTTGCACTAGTCTAAAACTCCATGATTTCCTCCGCGATCATT
crRNA-R:AATGATCGCGGAGGAAATCATGGAGTTTTA
SEQ ID NO.2GACTAGTGCAAATTTGCACCAGTGCCTATAGTGAGTCGT ATTA。
3.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:
crRNA GGCUACUACACUGGUGCAAAUUUGCACU
SEQ ID NO.3AGUCUAAAACUCAUCCACUUCCACAGCGGGUGGGCGUC。
4.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:
cTnI-F CGTGCAGTACGCCAACCTTTCTCATGCGCT
SEQ ID NO.4GCCCCTCTTATAATACGACTCACTATAGGTCGAATGATCGCGGAGGAAATCATGGAAATCCACA
cTnI-R TGTGGATTTCCATGATTTCCTCCGCGATCAT
SEQ ID NO.5TCGACCTATAGTGAGTCGTATTA。
5.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:所述步骤(5)所述的CRISPR Cas13d蛋白表达采用pET28a-MH6-RspCas13d质粒转入大肠杆菌表达载体DE3感受态细胞BL21实现。
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