[发明专利]一种基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法在审

专利信息
申请号: 202210363235.1 申请日: 2022-04-07
公开(公告)号: CN114839381A 公开(公告)日: 2022-08-02
发明(设计)人: 冯致远;张晶晶 申请(专利权)人: 南京大学
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;G01N33/58;C12N15/115;C12N15/113
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 冒艳
地址: 210023 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 crispr cas13d 检测 心肌 肌钙蛋白 方法
【权利要求书】:

1.一种基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:包括如下步骤:

(1)基于标记有cTnI抗体的酶标板,结合待测物中的cTnI,孵育形成抗体-cTnI复合物;

(2)两条ssDNA退火形成双链cTnI DNA适配体;

(3)适配体与cTnI-抗体复合物孵育,结合形成抗体-cTnI-适配体三元夹心结构;

(4)抗体-cTnI-适配体三元夹心结构与T7 RNA聚合酶Mix混合,通过识别双链DNA适配体的T7启动子序列启动转录合成激活子RNA;

(5)CRISPR Cas13d蛋白与crRNA按比例混合,锚定形成Cas-crRNA核糖核酸复合物;

(6)向步骤(4)的产物中加入核糖核酸复合物和荧光信号报告分子,Cas-crRNA核糖核酸复合物可特异性识别激活子RNA,激活Cas蛋白的侧切活性并切割荧光报告分子,检测相关动力学和终点荧光值。

2.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:

crRNA-F:TAATACGACTCACTATAGGCACTGGTGCAA

SEQ ID NO.1ATTTGCACTAGTCTAAAACTCCATGATTTCCTCCGCGATCATT

crRNA-R:AATGATCGCGGAGGAAATCATGGAGTTTTA

SEQ ID NO.2GACTAGTGCAAATTTGCACCAGTGCCTATAGTGAGTCGT ATTA。

3.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:

crRNA GGCUACUACACUGGUGCAAAUUUGCACU

SEQ ID NO.3AGUCUAAAACUCAUCCACUUCCACAGCGGGUGGGCGUC。

4.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:

cTnI-F CGTGCAGTACGCCAACCTTTCTCATGCGCT

SEQ ID NO.4GCCCCTCTTATAATACGACTCACTATAGGTCGAATGATCGCGGAGGAAATCATGGAAATCCACA

cTnI-R TGTGGATTTCCATGATTTCCTCCGCGATCAT

SEQ ID NO.5TCGACCTATAGTGAGTCGTATTA。

5.根据权利要求1所述的基于CRISPR Cas13d检测心肌肌钙蛋白I的方法,其特征在于:所述步骤(5)所述的CRISPR Cas13d蛋白表达采用pET28a-MH6-RspCas13d质粒转入大肠杆菌表达载体DE3感受态细胞BL21实现。

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