[发明专利]唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的LAMP双链检测探针、冻干微球及其制备方法和检测方法在审
申请号: | 202210344648.5 | 申请日: | 2022-03-31 |
公开(公告)号: | CN114703304A | 公开(公告)日: | 2022-07-05 |
发明(设计)人: | 许世伟;许远;邵俊影;吴镇宇;王欣;林圣博 | 申请(专利权)人: | 河南冠宇仪器有限公司;河南中检食安生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 成都顶峰专利事务所(普通合伙) 51224 | 代理人: | 钱学宇 |
地址: | 450000 河南省郑*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 唐菖蒲 霍尔 德氏菌 lamp 检测 探针 冻干微球 及其 制备 方法 | ||
1.一种唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的LAMP双链检测探针,其特征在于,所述双链检测探针包括发光探针和淬灭探针;
发光探针位于内引物FIP上,在所述内引物FIP序列的5’端标记有荧光发光基团,所述内引物FIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
淬灭探针与所述内引物FIP的5’端前20个序列互补,所述淬灭探针的3’端标记有荧光淬灭基团,淬灭探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.根据权利要求1所述的唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的LAMP双链检测探针,其特征在于,所述荧光发光基团包括FAM、VIC、TET;
所述荧光淬灭基团包括TAMRA、QSY、BHQ。
3.一种用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球,其特征在于,所述冻干微球中含有如权利要求1或2所述的LAMP双链检测探针。
4.根据权利要求3所述的用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球,其特征在于,所述冻干微球还包括检测引物组,所述检测引物组针对唐菖蒲伯克霍尔德氏菌16S~23S rRNA基因区间保守序列设计,所述检测引物组包括外引物F3、外引物B3、内引物FIP、内引物BIP;
所述外引物F3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
所述外引物B3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述内引物FIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
所述内引物BIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
5.根据权利要求4所述的用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球,其特征在于,所述双链检测探针中所述发光探针和淬灭探针的浓度比为1:1.2~1.8。
6.根据权利要求4所述的用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球,其特征在于,所述外引物F3和外引物B3的浓度均为0.15~0.25μM,所述内引物FIP和所述内引物BIP的浓度均为1.5~1.7μM。
7.一种用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球的制备方法,其特征在于,其包括:
将如权利要求1或2所述的LAMP双链检测探针、检测引物组与LAMP反应基液混合,得到扩增反应体系;
将所述扩增反应体系与冻干保护剂混合,逐滴滴入液氮中,控制每个液滴的体积为23~26μL,速冻成球后,冷冻干燥;
其中,所述检测引物组包括外引物F3、外引物B3、内引物FIP、内引物BIP;
所述外引物F3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
所述外引物B3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述内引物FIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
所述内引物BIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
8.根据权利要求7所述的用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球的制备方法,其特征在于,所述LAMP反应基液包括:BST聚合酶、dNTPs、MgSO4、显色剂、甜菜碱、pH调节剂、ddH2O和buffer。
9.根据权利要求7所述的用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌LAMP检测的冻干微球的制备方法,其特征在于,所述扩增反应体系与所述冻干保护剂的体积比为14~16:8;
所述冻干保护剂包括海藻糖、PEG20000和甘氨酸中的至少一种。
10.一种唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的LAMP双链检测方法,其特征在于,其包括:
将如权利要求3~6任一项所述的冻干微球加水复溶后,形成LAMP反应体系;
将来自待测样品中的模板DNA与所述LAMP反应体系混合,于60~65℃下反应50~70min,进行LAMP扩增。
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