[发明专利]一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒及方法在审
申请号: | 202210331156.2 | 申请日: | 2022-03-30 |
公开(公告)号: | CN114774565A | 公开(公告)日: | 2022-07-22 |
发明(设计)人: | 宫鹏涛;李珊;曹松高;姜维娜;李建华;张西臣;于艳辉;曹利利;李新;王晓岑 | 申请(专利权)人: | 吉林大学 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/6804;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 北京和联顺知识产权代理有限公司 11621 | 代理人: | 孙伟新 |
地址: | 130012 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 rpa crispr cas12a 体系 可视化 检测 阴道 滴虫 试剂盒 方法 | ||
1.一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒,包括试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包含一对用于扩增阴道毛滴虫actin基因的特异性RPA引物对、用于CRISPR Cas12a反应的crRNA、荧光报告基团、侧向流免疫层析报告基团和Cas12/13通用侧流层析试纸条,以及用于CRISPR反应的缓冲液和Cas12a蛋白。
2.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒,其特征在于:所述Cas12a蛋白为pGEX-4T-1-Cac12a重组蛋白。
3.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒,其特征在于:所述用于扩增阴道毛滴虫actin基因的特异性RPA引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:11和16所示,用于CRISPR Cas12a反应的crRNA互补的DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
4.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒及方法,其特征在于:所述用于CRISPR Cas12a反应的crRNA的报告探针为含有TTATT的单链DNA报告序列;用于荧光检测时,荧光报告探针为5′6-FAM-TTATT-BHQ1-3′,用于侧向流免疫层析检测时,试纸条报告探针为5′6-FAM-TTATT-Biotin-3′。
5.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒检测阴道毛滴虫时,RPA反应体系20μL:其中包括RPA上游扩增引物0.50μM,RPA下游扩增引物0.50μM,1×Rehydration Buffer,MgOAc 14mM,待检测样本基因组DNA2μL,其余用水补足至20μL;RPA扩增程序为:恒温37℃或39℃,反应30min。
6.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒,其特征在于:所述用于CRISPR反应的缓冲液包括:Tris-HCl pH=8.020mM、KCl100mM、MgCl25mM、DTT 1mM、5%甘油、肝素50μg/mL。
7.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒检测阴道毛滴虫时,CRISPR Cas12a检测体系50μL:包含100ng RPA扩增靶基因产物,crRNA250nM、RNase Inhibitor0.5μL、探针200nM、Tris-HCl pH=8.020mM、KCl 100mM、MgCl25mM、DTT1mM、5%甘油、肝素50μg/mL、加ddH2O补足至50μL;CRISPR程序为:使用EasyPGX定量PCR仪37℃反应40min,每隔2min采集一次FAM荧光,或在37℃水浴锅反应1h后加入无酶水补足至80uL后滴加于CRISPR Cas12a/Cas13a专用试纸条上肉眼观察结果。
8.根据权利要求1所述的一种基于RPA-CRISPR-Cas12a体系可视化检测阴道毛滴虫的方法,其特征在于:将RPA特异性扩增与crRNA特异性序列鉴定相结合,使增强的Cas12a检测更具特异性;并在37℃条件下进行检测,适合在缺乏PCR仪等仪器设备的实验室或现场使用;同时可以根据现有条件选取荧光法(通过仪器或蓝光激发肉眼观察)或侧流层析试纸条法(直接裸眼观察)。
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