[发明专利]遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法在审
| 申请号: | 202210326085.7 | 申请日: | 2022-03-29 |
| 公开(公告)号: | CN114634970A | 公开(公告)日: | 2022-06-17 |
| 发明(设计)人: | 富磊;江海松;顾天生;史映雪 | 申请(专利权)人: | 南通惠皓医疗科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6883 |
| 代理公司: | 南通鼎点知识产权代理事务所(普通合伙) 32442 | 代理人: | 朱建 |
| 地址: | 226000 江苏省南通市启*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 遗传性 阿尔兹海默症 致病 基因 panel 检测 方法 | ||
1.遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于包括以下步骤:
S1,提取检测对象的基因组DNA;
S2,对提取的基因组DNA进行定量,并构建文库;
S3,对文库进行定量操作;
S4,上机测序;
S5,数据分析得到致病位点相关信息。
2.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S2中构建文库的具体步骤如下:
S201,将基因组DNA进行片段化;
S202,将片段化的基因组DNA进行末端修复和3'末端添加碱基A;
S203,将3'末端添加碱基A的产物连接扩增接头以进行有效连接产物的富集;
S204,将有效连接产物进行PCR扩增来富集有效产物;
S205,使用探针对富集的模板中的目标区域进行捕获;
S206,将捕获的目标片段分离;
S207,加上完整接头获得捕获文库。
3.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S1中的基因组DNA来源于人类。
4.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S1中的提取方法包括纯化柱纯化、磁珠纯化或酚氯仿提取。
5.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S2和S3中的定量方法包括基于荧光定量原理的定量装置定量、Q-PCR定量和电泳。
6.根据权利要求2所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S201中对基因组DNA进行片段化的方法包括超声破碎、转座酶酶切和限制性内切酶酶切。
7.根据权利要求2所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述扩增接头为特定的Ill接头。
8.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S2中构建的文库可通过浓度检测和长度分布检测来进行质量评价,然后使用高通量测序平台进行测序。
9.根据权利要求4所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述磁珠纯化的具体方法为:
将打断后的样品转移至200μl PCR管内,向样品加入90μl室温温育后的AgencourtAMPure XP磁珠,用移液器吸打混匀数次;
室温孵育5min后,将PCR管置于DynaMag-96 Side(标注一下中文名称)磁力架上3min;
移除上清,PCR管继续放置在磁力架上,向PCR管内加入200μl 80%乙醇溶液,静置30s;
移除上清,再加入200μl 80%乙醇溶液,静置30s后彻底移除上清;
室温静置5min,使残留乙醇彻底挥发;
加入34μl Nuclease-free water,将离心管从磁力架取下,将移液器调至30μl轻轻吸打重悬磁珠,避免产生气泡,室温静置2min;
将200μl PCR管置于磁力架上2min;
用移液器吸取31.5μl上清液,转移到新的200μl PCR管内并置于冰盒上,在反应管上标记样本编号,准备下一步反应。
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