[发明专利]遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法在审

专利信息
申请号: 202210326085.7 申请日: 2022-03-29
公开(公告)号: CN114634970A 公开(公告)日: 2022-06-17
发明(设计)人: 富磊;江海松;顾天生;史映雪 申请(专利权)人: 南通惠皓医疗科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6883
代理公司: 南通鼎点知识产权代理事务所(普通合伙) 32442 代理人: 朱建
地址: 226000 江苏省南通市启*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 遗传性 阿尔兹海默症 致病 基因 panel 检测 方法
【权利要求书】:

1.遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于包括以下步骤:

S1,提取检测对象的基因组DNA;

S2,对提取的基因组DNA进行定量,并构建文库;

S3,对文库进行定量操作;

S4,上机测序;

S5,数据分析得到致病位点相关信息。

2.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S2中构建文库的具体步骤如下:

S201,将基因组DNA进行片段化;

S202,将片段化的基因组DNA进行末端修复和3'末端添加碱基A;

S203,将3'末端添加碱基A的产物连接扩增接头以进行有效连接产物的富集;

S204,将有效连接产物进行PCR扩增来富集有效产物;

S205,使用探针对富集的模板中的目标区域进行捕获;

S206,将捕获的目标片段分离;

S207,加上完整接头获得捕获文库。

3.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S1中的基因组DNA来源于人类。

4.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S1中的提取方法包括纯化柱纯化、磁珠纯化或酚氯仿提取。

5.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S2和S3中的定量方法包括基于荧光定量原理的定量装置定量、Q-PCR定量和电泳。

6.根据权利要求2所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S201中对基因组DNA进行片段化的方法包括超声破碎、转座酶酶切和限制性内切酶酶切。

7.根据权利要求2所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述扩增接头为特定的Ill接头。

8.根据权利要求1所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述步骤S2中构建的文库可通过浓度检测和长度分布检测来进行质量评价,然后使用高通量测序平台进行测序。

9.根据权利要求4所述的遗传性阿尔兹海默症致病基因panel检测方法,其特征在于:所述磁珠纯化的具体方法为:

将打断后的样品转移至200μl PCR管内,向样品加入90μl室温温育后的AgencourtAMPure XP磁珠,用移液器吸打混匀数次;

室温孵育5min后,将PCR管置于DynaMag-96 Side(标注一下中文名称)磁力架上3min;

移除上清,PCR管继续放置在磁力架上,向PCR管内加入200μl 80%乙醇溶液,静置30s;

移除上清,再加入200μl 80%乙醇溶液,静置30s后彻底移除上清;

室温静置5min,使残留乙醇彻底挥发;

加入34μl Nuclease-free water,将离心管从磁力架取下,将移液器调至30μl轻轻吸打重悬磁珠,避免产生气泡,室温静置2min;

将200μl PCR管置于磁力架上2min;

用移液器吸取31.5μl上清液,转移到新的200μl PCR管内并置于冰盒上,在反应管上标记样本编号,准备下一步反应。

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