[发明专利]循环游离DNA中肿瘤相关突变基因检测的参考品在审
申请号: | 202210293003.3 | 申请日: | 2022-03-23 |
公开(公告)号: | CN114717314A | 公开(公告)日: | 2022-07-08 |
发明(设计)人: | 王涛;司慧娟;闫慧慧;马亚茹 | 申请(专利权)人: | 杭州瑞普基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 北京卓孚律师事务所 11821 | 代理人: | 谢梦欣;宋明 |
地址: | 311100 浙江省杭州市余杭区*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 循环 游离 dna 肿瘤 相关 突变 基因 检测 参考 | ||
1.用于循环游离DNA突变检测的参考品,其中,所述参考品中包含:
野生型DNA片段,和
一种或多种突变型DNA片段,每种所述突变型DNA片段具有一种或多种碱基突变并且编码的氨基酸序列具有表1中列出的一种或多种氨基酸突变。
2.根据权利要求1所述的参考品,其中,所述参考品中的突变型DNA片段编码的氨基酸序列包含选自如下(a)~(i)中任一组的氨基酸突变组合,并且不含其他组的任何氨基酸突变:
(a)EGFR的氨基酸突变p.E746_A750del,
EGFR的氨基酸突变p.T790M,
EGFR的氨基酸突变p.L858R,
KRAS的氨基酸突变p.G12C;
(b)EGFR的氨基酸突变p.G719A,
EGFR的氨基酸突变p.E746_A750del,
NRAS的氨基酸突变p.Q61K,
KRAS的氨基酸突变p.G12V;
(c)EGFR的氨基酸突变p.G719S,
ALK的氨基酸突变EML4-ALK,
BRAF的氨基酸突变p.V600E,
KRAS的氨基酸突变p.G12D,
PIK3CA的氨基酸突变p.H1047R;
(d)EGFR的氨基酸突变p.L747_P753 indel S,
EGFR的氨基酸突变p.S768I,
KRAS的氨基酸突变p.G13C,
ERBB2的氨基酸突变p.A775_G776insYVMA;
(e)EGFR的氨基酸突变p.C797S,
KRAS的氨基酸突变p.G13D,
PIK3CA的氨基酸突变p.E545K;
(f)KRAS的氨基酸突变p.G12S,
EGFR的氨基酸突变p.L747_A750delinsP,
PIK3CA的氨基酸突变p.E542K;
(g)ALK的氨基酸突变EML4-ALK,
KRAS的氨基酸突变p.G12A;
(h)KRAS的氨基酸突变p.Q61H,
EGFR的氨基酸突变p.L861Q,
MET的氨基酸突变14exon skipping;
(i)EGFR的氨基酸突变p.E746_S752delinsV,
EGFR的氨基酸突变D770_N771insG,
RET的氨基酸突变KIF5B-RET,
ROS1的氨基酸突变CD74-ROS1,
EGFR的氨基酸突变p.G719C。
3.根据权利要求1或2所述的参考品,其中,所述突变型DNA片段和野生型DNA片段具有与cfDNA相似的长度,例如具有130-170bp的平均长度。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的参考品,其中,所述参考品中所述突变型DNA片段和野生型DNA片段的比例使得所述碱基突变的频率为0.1~10%,优选为1~5%,更优选为约3%。
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