[发明专利]循环游离DNA中肿瘤相关突变基因检测的参考品在审

专利信息
申请号: 202210293003.3 申请日: 2022-03-23
公开(公告)号: CN114717314A 公开(公告)日: 2022-07-08
发明(设计)人: 王涛;司慧娟;闫慧慧;马亚茹 申请(专利权)人: 杭州瑞普基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;C40B40/06
代理公司: 北京卓孚律师事务所 11821 代理人: 谢梦欣;宋明
地址: 311100 浙江省杭州市余杭区*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 循环 游离 dna 肿瘤 相关 突变 基因 检测 参考
【权利要求书】:

1.用于循环游离DNA突变检测的参考品,其中,所述参考品中包含:

野生型DNA片段,和

一种或多种突变型DNA片段,每种所述突变型DNA片段具有一种或多种碱基突变并且编码的氨基酸序列具有表1中列出的一种或多种氨基酸突变。

2.根据权利要求1所述的参考品,其中,所述参考品中的突变型DNA片段编码的氨基酸序列包含选自如下(a)~(i)中任一组的氨基酸突变组合,并且不含其他组的任何氨基酸突变:

(a)EGFR的氨基酸突变p.E746_A750del,

EGFR的氨基酸突变p.T790M,

EGFR的氨基酸突变p.L858R,

KRAS的氨基酸突变p.G12C;

(b)EGFR的氨基酸突变p.G719A,

EGFR的氨基酸突变p.E746_A750del,

NRAS的氨基酸突变p.Q61K,

KRAS的氨基酸突变p.G12V;

(c)EGFR的氨基酸突变p.G719S,

ALK的氨基酸突变EML4-ALK,

BRAF的氨基酸突变p.V600E,

KRAS的氨基酸突变p.G12D,

PIK3CA的氨基酸突变p.H1047R;

(d)EGFR的氨基酸突变p.L747_P753 indel S,

EGFR的氨基酸突变p.S768I,

KRAS的氨基酸突变p.G13C,

ERBB2的氨基酸突变p.A775_G776insYVMA;

(e)EGFR的氨基酸突变p.C797S,

KRAS的氨基酸突变p.G13D,

PIK3CA的氨基酸突变p.E545K;

(f)KRAS的氨基酸突变p.G12S,

EGFR的氨基酸突变p.L747_A750delinsP,

PIK3CA的氨基酸突变p.E542K;

(g)ALK的氨基酸突变EML4-ALK,

KRAS的氨基酸突变p.G12A;

(h)KRAS的氨基酸突变p.Q61H,

EGFR的氨基酸突变p.L861Q,

MET的氨基酸突变14exon skipping;

(i)EGFR的氨基酸突变p.E746_S752delinsV,

EGFR的氨基酸突变D770_N771insG,

RET的氨基酸突变KIF5B-RET,

ROS1的氨基酸突变CD74-ROS1,

EGFR的氨基酸突变p.G719C。

3.根据权利要求1或2所述的参考品,其中,所述突变型DNA片段和野生型DNA片段具有与cfDNA相似的长度,例如具有130-170bp的平均长度。

4.根据权利要求1~3中任一项所述的参考品,其中,所述参考品中所述突变型DNA片段和野生型DNA片段的比例使得所述碱基突变的频率为0.1~10%,优选为1~5%,更优选为约3%。

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