[发明专利]基于微流控芯片-PCR技术检测布鲁氏菌的方法及系统在审

专利信息
申请号: 202210125427.9 申请日: 2022-02-10
公开(公告)号: CN114480686A 公开(公告)日: 2022-05-13
发明(设计)人: 杜彦丹;赵志军;李翔;董占柱;孙欣;陈昊;包春喜;郝明媛;李英智;牛艺卿 申请(专利权)人: 杜彦丹;陈昊
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12Q1/6837;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 内蒙古欣洋瑞专利代理有限公司 15110 代理人: 刘永珍
地址: 022150 内蒙古自治区呼*** 国省代码: 内蒙古;15
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摘要:
搜索关键词: 基于 微流控 芯片 pcr 技术 检测 布鲁氏菌 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种检测布鲁氏菌的方法,其特征在于,该方法包括对待测样本进行目的DNA的提取、PCR扩增以及反向斑点杂交,其中:

目的DNA的提取:采用NaI磁珠法对待测样本进行目的DNA的提取;

PCR扩增:以提取获得的DNA为模板,采用针对布鲁氏菌BCSP-31基因设计的引物,进行PCR扩增;

反向斑点杂交:PCR扩增产物在杂交膜上进行反向斑点杂交;其中,杂交膜上固定有针对布鲁氏菌BCSP-31基因设计的检测探针。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述待测样本为来自个体的离体样本或环境样本;所述来自个体的离体样本为血液样本。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,NaI磁珠法中,采用的提取试剂包括1.5-6mol/L的NaI裂解液,蛋白酶K,磁珠,以及异丙醇;

优选地,针对每50μl待测样本,采用的提取试剂包括50μl ddH2O、100μl NaI裂解液、5μlPK、5-20μl磁珠以及20-100μl异丙醇。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目的DNA的提取利用微流控芯片技术全自动进行,或是手工提取;

其中,手工提取过程优选包括:

在离心管中加入待测样本,并加入裂解液NaI,混匀,并加入蛋白酶K,进行孵育;

在上述离心管中加入磁珠和异丙醇,混匀;

将离心管放于磁力架上静置,待Magbeads完全吸附于离心管侧壁后彻底弃去溶液,并根据需要进行漂洗;

离心管开盖室温晾干,加入洗脱液,孵育;

将离心管放于磁力架上静置,待Magbeads完全吸附于离心管侧壁后用移液器将洗脱液转移至新的离心管中-20℃保存备用。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,PCR扩增过程中,针对布鲁氏菌BCSP-31基因设计的引物具有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示序列。

6.根据权利要求1或4所述的方法,其特征在于,PCR扩增过程中,采用15μPCR反应体系,包括:DNA聚合酶(2×Taq Master Mix)7.5ul,正、反向引物各1.5μl(0.5μmol/μl),ddH2O1.5μl,核酸模板3μl;反应循环参数:95℃预变性3min,95℃10s、50℃30s、72℃30s,45个热循环,72℃终延伸1min;

优选地,所述PCR扩增过程利用微流控芯片技术全自动进行。

7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,反向斑点杂交过程中,针对布鲁氏菌BCSP-31基因设计的检测探针具有如SEQ ID No.3所示序列;

优选地,所述反向斑点杂交过程利用微流控芯片技术全自动进行。

8.根据权利要求1或7所述的方法,其特征在于,反向斑点杂交过程中,杂交膜上还固定有质控探针;

优选地,杂交膜划分为多个点位,各探针采用微量点样技术被固定在杂交膜的不同点位上,其中检测探针至少1个点,空白对照探针、内参质控探针GB各至少1个点,显色质控探针重复至少3个点。

9.一种用于实现权利要求1-8任一项所述检测布鲁氏菌的方法的检测系统,其特征在于,该检测系统包括:

用于实现所述目的DNA的提取的提取试剂材料;

用于实现所述PCR扩增的扩增试剂材料;

用于实现反向斑点杂交的试剂材料。

10.根据权利要求9所述的检测系统,其特征在于,该检测系统还包括分析单元,所述分析单元按照以下方法对反向斑点杂交结果进行分析判断:

如果杂交膜的显色质控探针点有阳性斑点,内参质控点有阳性斑点,且有检测探针阳性斑点出现,提示样本为布鲁氏菌阳性;或者

如果杂交膜的显色质控探针点有阳性斑点,内参质控点有阳性斑点,且无检测探针阳性斑点出现,提示样本为布鲁氏菌阴性。

11.一种用于实现权利要求1-8任一项所述检测布鲁氏菌的方法的引物和检测探针组合物,其特征在于,所述引物具有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示序列;所述检测探针具有如SEQ ID No.3所示序列。

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