[发明专利]HDS在预测胃癌患者的预后、指导术后辅助化疗和预测免疫治疗疗效中的应用有效
申请号: | 202210109553.5 | 申请日: | 2022-01-29 |
公开(公告)号: | CN114134232B | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 申占龙;林易霖;叶颖江;王杉 | 申请(专利权)人: | 北京大学人民医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16B30/00;G16B40/00 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 朱萍 |
地址: | 100044 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hds 预测 胃癌 患者 预后 指导 术后 辅助 化疗 免疫 治疗 疗效 中的 应用 | ||
1.一种HDS评分的构建方法,所述构建方法包括如下步骤:
1)检测基因标志物的mRNA表达水平;所述基因标志物为:C1S、COLEC12、CNN3、LRP12、RCAN2、TSPYL5、FAM198B、GPRASP1、L3HYPDH、PBX1、BAG2、PPP1R14A、RAB23、SEPT11、SERINC1、PJA2、BNIP2、CLIC4、TBC1D19、FBXO30、PTPRM、GOLGA8N、GINM1、RASL12、OSTM1、PPP1R12A、TMEM200B、ARHGEF1、RNF146、NDNL2、ITGB1、PAIP2、ZNF570、ZFP82、NRP2、BICD2、ADAM33、PDZD2、SPIN1、FKSG49、LRP1、ZSCAN18、FBXW12、RECK、TRAF7、RPS6、NDOR1、CC2D1A、SERINC2、ESCO2、ZBTB7B、NOP16、SPC24、USP5、AK2、CHAF1A、MCCC2、GEMIN4、TNK1、EARS2、PA2G4、HNRNPAB、GNAI3、UBE2D1、RNF126、SLC30A5、MYRF、PSME3、TUFM、YAF2、HMBS、SEMA4G、PCNXL3、DNAJA1、USP38、RCC1、SENP1、GSS、RASSF7、LMNB2、YRDC、LONP1、PDCD11、LACTB、FEN1、B3GNT3、MRPL4、NUS1、COASY、NUS1P3、ARHGEF16、HAUS6、GFM2、LYPLA1、HAUS1、ERCC6L、NEDD1、ME2、TMX1、CPNE3、ELMO3、PTPRH、HSPA4L;
2)采用主成分分析法PCA构建HDS评分计算公式;
HDS评分计算公式如下所示:
HDS= QUOTE
其中,PC1i代表A基因第一主成分的特征得分,PC1j代表B基因第一主成分的特征得分;
A基因为:TRAF7、RPS6、NDOR1、CC2D1A、SERINC2、ESCO2、ZBTB7B、NOP16、SPC24、USP5、AK2、CHAF1A、MCCC2、GEMIN4、TNK1、EARS2、PA2G4、HNRNPAB、GNAI3、UBE2D1、RNF126、SLC30A5、MYRF、PSME3、TUFM、YAF2、HMBS、SEMA4G、PCNXL3、DNAJA1、USP38、RCC1、SENP1、GSS、RASSF7、LMNB2、YRDC、LONP1、PDCD11、LACTB、FEN1、B3GNT3、MRPL4、NUS1、COASY、NUS1P3、ARHGEF16、HAUS6、GFM2、LYPLA1、HAUS1、ERCC6L、NEDD1、ME2、TMX1、CPNE3、ELMO3、PTPRH、HSPA4L;
B基因为:C1S、COLEC12、CNN3、LRP12、RCAN2、TSPYL5、FAM198B、GPRASP1、L3HYPDH、PBX1、BAG2、PPP1R14A、RAB23、SEPT11、SERINC1、PJA2、BNIP2、CLIC4、TBC1D19、FBXO30、PTPRM、GOLGA8N、GINM1、RASL12、OSTM1、PPP1R12A、TMEM200B、ARHGEF1、RNF146、NDNL2、ITGB1、PAIP2、ZNF570、ZFP82、NRP2、BICD2、ADAM33、PDZD2、SPIN1、FKSG49、LRP1、ZSCAN18、FBXW12、RECK。
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