[发明专利]儿童克罗恩病标志基因及其应用

说明书

本发明公开了一种儿童克罗恩病基因标志物及其应用，该儿童克罗恩病基因标志物包括第一基因集中的至少之一，因此，进一步提出了一种试剂盒，该试剂盒包括适于检测第一基因集中的至少一种基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：S16_GI_0001907和S24_GI_0000414。其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1、2中的序列具有不小于90％的同一性。本发明提出的基因相较于健康个体，在儿童克罗恩病患者群体中显著富集，能够作为健康群体和儿童克罗恩病患者群体的区分标志，可以作为检测和/或治疗儿童克罗恩病的标志物。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体的，本发明涉及儿童克罗恩病标志基因及其应用，更具体的，本发明涉及一种试剂盒、试剂在制备试剂盒中的用途、用于预防或者治疗儿童克罗恩病的药物组合物或者食品组合物、确定个体是否患有儿童克罗恩病方法、确定个体是否患有儿童克罗恩病的装置、一种装置、一种筛选药物的方法。

背景技术

儿童克罗恩病(Crohn’s disease,CD)又称阶段性肠炎或者阶段性大肠炎，是一种肠道炎症性疾病。临床表现为腹痛、腹泻、肠梗阻，伴有发热、营养障碍等肠外表现，最多见的是出现肛周的一些病变，如瘘管、肛周脓肿，但它病变部位不止局限在结肠的病变，它在食管、胃、十二指肠、小肠都可以发生病变，是全胃肠道的病变。

克罗恩病进展比较缓慢，起病大多隐匿、缓慢，从发病早期症状出现(如腹部隐痛或间歇性腹泻)到确诊一般需要数月至数年，病程呈慢性、长短不等的活动期与缓解期交替。少数急性起病，可表现为急腹症，酷似急性阑尾炎，因此可能会发生误判。此种慢性疾病的诊断，需要结合临床表现，X线检查、结肠镜检查或者活组织检查结果进行综合分析，但诊断过程较复杂，对于鉴别比较困难而又有手术指征者还需要手术探查才可获得病理诊断。

随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的高速发展，基因筛查成为克罗恩病诊断的又一方向，通过此种方法有可能发现克罗恩病的潜在人群，越来越多的证据支持生态失调假说，即共生和致病性肠道微生物与宿主免疫系统相互作用的平衡发生了变化，导致了克罗恩病的发生。克罗恩病的风险基因位点与调节宿主免疫系统的模式识别受体(PRRs)的细胞因子有关(McGovern et al.,2015)。由于全球年发病率的增加(Molodeckyet al.,2012)，特别是儿童(Henderson et al.,2012)，因此越来越需要了解克罗恩病的病因，结肠样本较粪便样本而言，能够更加准确的反映肠道内的真实情况。通过研究结肠样本的基因，有助于克罗恩病的早期诊断，也有利于揭示克罗恩病基因标志物。

发明内容

本发明旨在至少在一定程度上解决上述技术问题之一或至少提供一种商业选择。

在本发明的第一方面，提供一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中至少一种基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本发明具体实施例的试剂盒，包含可以准确的检测第一基因集中的至少一种基因的试剂，因此，所述试剂盒可以准确检测生物样品中是否存在所述第一基因集中的至少一种基因，更进一步地，也可以准确区分或诊断儿童克罗恩病患者和健康个体。