[发明专利]儿童克罗恩病标志基因及其应用在审

申请号：	202111672780.0	申请日：	2021-12-31
公开（公告）号：	CN114317717A	公开（公告）日：	2022-04-12
发明（设计）人：	宋瑞雪;郑智俊;李婷	申请（专利权）人：	青岛锐翌精准医学检验有限公司
主分类号：	C12Q1/6883	分类号：	C12Q1/6883;C12Q1/6869;A61K45/00;A61P1/00;A61P29/00;G16B30/10;A23L33/10
代理公司：	北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201	代理人：	黄德海
地址：	266500 山东省青岛市黄岛区团结路2***	国省代码：	山东;37
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摘要：
搜索关键词：	儿童克罗恩病标志基因及其应用
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【权利要求书】：

1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一基因集中的至少一个基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性。

2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测V1.UC56-1_GL0008645基因的试剂，其中，所述V1.UC56-1_GL0008645基因与SEQ ID NO：3所示的核酸序列对应，所述V1.UC56-1_GL0008645基因与其对应的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一基因集中全部所述基因的试剂。

4.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因，所述试剂盒用于诊断儿童克罗恩病或者检测儿童克罗恩病的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：

S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性。

5.根据权利要求4所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测V1.UC56-1_GL0008645基因，其中，所述V1.UC56-1_GL0008645基因与SEQ ID NO：3所示的核酸序列对应，所述V1.UC56-1_GL0008645基因与其对应的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

6.一种用于预防或者治疗儿童克罗恩病的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有提高V1.UC56-1_GL0008645基因丰度的物质，其中，所述V1.UC56-1_GL0008645基因与SEQ ID NO：3所示的核酸序列对应，所述V1.UC56-1_GL0008645基因与其对应的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

7.一种确定个体是否患有儿童克罗恩病的方法，其特征在于，包括：

(1)确定所述个体的结肠样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和V1.UC56-1_GL0008645基因中的至少一种基因；

(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有儿童克罗恩病；

其中，所述第一基因集由以下基因组成：S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性；

所述V1.UC56-1_GL0008645基因与SEQ ID NO：3所示的核酸序列对应，所述

V1.UC56-1_GL0008645基因与其对应的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，步骤(1)进一步包括：

获得所述个体的结肠样本中的核酸测序数据；

将所述测序数据与参考基因组进行比对；

基于所述比对的结果，确定所述标志基因的丰度。

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