[发明专利]KPC型碳青霉烯酶基因检测试剂盒、组合物及其应用

权利要求书

1.用于检测KPC型碳青霉烯酶基因的组合物，其特征在于，所述组合物包括引物对和crRNA，所述crRNA的序列由用于与Cas13a蛋白结合的锚定序列和靶向KPC型碳青霉烯酶基因靶点序列的向导序列组成，所述向导序列为SEQ ID No.1。

2.根据权利要求1所述的组合物，其特征在于，所述crRNA的核苷酸序列为SEQ IDNo.2。

3.根据权利要求1或2所述的组合物，其特征在于，所述引物对由引物KPC-F3和引物KPC-R3组成，所述引物KPC-F3为SEQ ID No.3所示的单链DNA分子；所述引物KPC-R3为SEQID No.4所示的单链DNA分子。

4.用于检测KPC型碳青霉烯酶基因的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求1-3中任一项所述的组合物。

5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括Cas13a蛋白。

6.根据权利要求4或5所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括报告RNA。

7.权利要求1或2中所述的crRNA或权利要求1或2中所述的crRNA与Cas13a蛋白的复合物。

8.一种检测KPC型碳青霉烯酶基因的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

A1)提取待测样本DNA；

A2)以所述DNA为模板，利用权利要求3中所述的引物KPC-F3和引物KPC-R3进行PCR扩增，得到扩增产物；

A3)利用CRISPR-Cas13a检测体系进行检测；

所述CRISPR-Cas13a检测体系包括权利要求1或2中所述的crRNA。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述CRISPR-Cas13a检测体系还包括Cas13a蛋白和/或转录酶。

10.权利要求1-3中任一项所述的组合物，和/或，权利要求7所述的crRNA或复合物的下述任一种应用：

B1)在检测KPC型碳青霉烯酶基因中的应用；

B2)在制备用于检测KPC型碳青霉烯酶基因的产品中的应用；

B3)在鉴定产碳青霉烯酶菌株中的应用；

B4)在制备用于鉴定产碳青霉烯酶菌株的产品中的应用；

B5)在检测微生物耐药性中的应用；

B6)在制备用于检测微生物耐药性的产品中的应用。