[发明专利]基于bGMS预测非小细胞肺癌免疫治疗疗效

权利要求书

1.一种基于cfDNA突变进行非小细胞肺癌免疫治疗疗效预测的模型的构建方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

步骤一：获取非小细胞肺癌患者免疫治疗队列数据，将数据按样本分为训练集和验证集，所述数据包含cfDNA基因突变和反应治疗疗效的疗效评价指标；

步骤二：利用训练集数据进行模型构建：

1)以cfDNA突变作为模型输入，以反应治疗疗效的疗效评价指标OS和PFS作为被预测指标，构建预测模型；所述构建过程中，为获得更具鲁棒性的模型，进行多次随机的模型构建；

2)构建整合多次结果的综合模型，获得影响免疫治疗疗效的cfDNA基因突变及其对应系数；所述对应系数为多次训练中所得到的系数的平均值，系数等于0的基因不纳入模型；

3)基于基因突变及对应系数，计算血液中游离基因组突变评分bGMS；

所述bGMS定义公式为

其中，i表示经过LASSO-Cox筛选的特征基因，n表示经过LASSO-Cox筛选的特征基因总数；mut_i表示特征基因是否突变状态，当mut_i＝0表示未发生突变，当mut_i＝1表示发生突变；coef_i表示特征基因对应的回归系数；

所述bGMS＝(0.018290887*TP53)+(0.050893165*KEAP1)+(0.024641*APC)+(0.004875089*FLT4)+(0.003746885*FLT1)+(0.005235822*BRAF)+(0.002520376*RB1)+(0.0020396*PTCH1)+(-0.001324723*ATM)+(-0.000794*MET)+(-0.001261613*GRM3)+(0.001618796*PIK3C3)+(0.000277626*EPHA7)+(-0.000387385*GABRA6)+(-0.0001808*ATR)；

4)确定分割点，将患者的风险等级分为高低两组；若患者bGMS大于分割点，则判断为治疗有效，若患者bGMS小于分割点，则判断治疗无效；所述分割点＝0；

步骤三：将所构建的模型在验证集中进行验证。

2.权利要求1所述的模型构建方法，其特征在于，所述1)中，

所述预测模型的构建使用LASSO-Cox构建预测模型；

所述构建过程中，为获得更具鲁棒性的模型，进行多次随机的模型构建，每次模型构建中均进行5折交叉验证，获得突变基因的系数。