[发明专利]一种检测CYP2C19基因多态性的引物组及试剂盒在审

专利信息
申请号: 202111616446.3 申请日: 2021-12-27
公开(公告)号: CN114150058A 公开(公告)日: 2022-03-08
发明(设计)人: 张祥林;张劲松;胡秋萍;魏鹏 申请(专利权)人: 上海美吉逾华生物医药科技有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12Q1/6848;C12N15/11
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 王秋霞;许亦琳
地址: 201204 上海市浦东新*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 cyp2c19 基因 多态性 引物 试剂盒
【说明书】:

发明涉及基因检测领域,特别是涉及一种检测CYP2C19基因多态性的引物组及试剂盒,所述引物组中包括能够分别检测CYP2C19*2 681G、CYP2C19*2 681A、CYP2C19*3 636G、CYP2C19*3 636A、CYP2C19*17‑806C、CYP2C19*17‑806T的上下游引物;所述试剂盒中包括PCR反应物和质控品,所述PCR反应物中包括所述引物组。本发明的试剂盒无需复杂的核酸提取纯化步骤,直接将血卡或全血样本中释放的核酸用于荧光PCR扩增,减少核酸提取纯化所增加的实验检测步骤、检测成本、检测周期和安全性等问题,满足临床对检测简单、快速和准确的需求。

技术领域

本发明涉及基因检测领域,特别是涉及一种检测CYP2C19基因多态性的引物组及试剂盒。

背景技术

细胞色素P450(CYP450)同工酶是人体内主要的药物代谢酶之一。CYP2C19是CYP450同工酶家族的重要成员,代谢的临床药物主要包括抗血小板药物(如氯吡格雷)和质子泵抑制剂(如奥美拉唑)等。编码CYP2C19酶的基因是CYP2C19基因,该基因位于10号染色体的10q24.2上。CYP2C19基因含有多个等位基因,最常见的是CYP2C19*2(c.681GA)、CYP2C19*3(c.636GA)和CYP2C19*17(c.-806CT)。CYP2C19*2和CYP2C19*3突变导致CYP2C19酶活性降低,而CYP2C19*17突变导致CYP2C19酶活性增强。CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17在中国人群的发生频率分别约为23.1-35%、2-7%和0.5-4%。

从药物代谢方面来说,CYP2C19基因不同等位基因突变组合,使人群出现超快代谢者(UM)、快代谢者(EM)、中间代谢者(IM)和慢代谢者(PM)4种表型。UM个体的基因型可为CYP2C19*17/*17纯合型或CYP2C19*1/*17杂合型;EM个体的基因型可为CYP2C19*1/*1纯合型;IM个体的基因型可为CYP2C19*1/*2、CYP2C19*1/*3、CYP2C19*2/*17或CYP2C19*3/*17杂合型;PM个体的基因型可为CYP2C19*2/*3、CYP2C19*2/*2和CYP2C19*3/*3杂合型或纯合型。研究表明,CYP2C19不同代谢类型与奥美拉唑的临床疗效相关,PM患者的疗效优于EM患者;而对氯吡格雷研究表明,IM患者需更改剂量达到抗血小板的疗效,而PM患者患者需要增加药量或改用其他抗凝血药物如替格瑞洛等。因此,对CYP2C19基因型检测,可以判断个体对药物代谢能力及疗效的情况,从而指导临床用药,具有重要的临床意义。

目前,检测CYP2C19基因多态性的方法有很多种,主要的方法有限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(PCR-RFLP)、Sanger测序法、基因芯片法、荧光定量PCR法等。Sanger测序法是检测基因多态性的金标准,但该方法由于检测成本较高、操作复杂以及检测周期长,不太适合临床推广使用。PCR-RFLP法无需购买昂贵检测设备,但是其操作复杂,步骤繁多且容易污染。基因芯片法通过PCR产物与探针杂交,通过比较信号强度判断基因型,但是由于PCR产物需要进行后续分析,操作繁琐且容易出现假阳性。荧光定量PCR法由于操作简单,检测时间短,全程闭管检测,减少产物交叉污染,已经成为临床常用的检测方法。以上方法均需提取和纯化核酸,核酸提取纯化流程不仅增加实验检测步骤、检测成本和检测周期,而且存在因操作失误导致检测失败的可能。因此,难以满足临床对检测简单、快速、准确的需求。为解决以上问题,亟需建立一种操作简便、检测快速、成本低、灵敏度高且结果准确的CYP2C19多态性检测试剂盒,从而满足临床诊断需求。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供一种检测CYP2C19基因多态性的引物组及试剂盒,用于解决现有技术中的问题。

为实现上述目的及其他相关目的,本发明提供一种检测CYP2C19基因多态性的引物组,所述引物组包括以下中的一对或多对引物:

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