[发明专利]一种非侵入性快速确定植物是否感染番茄黄化曲叶病毒的方法有效
| 申请号: | 202111596793.4 | 申请日: | 2021-12-24 | 
| 公开(公告)号: | CN114196789B | 公开(公告)日: | 2023-04-25 | 
| 发明(设计)人: | 褚栋;杨楠;丁天波;陶云荔 | 申请(专利权)人: | 青岛农业大学 | 
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/686 | 
| 代理公司: | 山东三邦知识产权代理事务所(普通合伙) 37308 | 代理人: | 肖太升;牛继梅 | 
| 地址: | 266109 山*** | 国省代码: | 山东;37 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 侵入 快速 确定 植物 是否 感染 番茄 黄化 病毒 方法 | ||
1.一种用于检测番茄黄化曲叶病毒的微滴式数字PCR的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物的核苷酸序列如下所示:
5’-CCGAAAGCCCAGAATATACAGA-3’(SEQ ID NO.1),
5’-CCAGATCCACGAGTAACATCAC-3’(SEQ ID NO.2)。
2.一种用于检测番茄黄化曲叶病毒的微滴式数字PCR的特异性探针,其特征在于,所述特异性探针的核苷酸序列如下所示:
5’-CCCATGTAAAGTCCAGTCTTATGAGCAACG-3’(SEQ ID NO.3)。
3.根据权利要求2所述的用于检测番茄黄化曲叶病毒的微滴式数字PCR的特异性探针,其特征在于,所述特异性探针的5’端标记有荧光基团,探针的3’端标记有淬灭基团;
所述荧光基团为FAM、TET、HEX、CY3或JOE中的一种;
所述淬灭基团为BHQ1、BHQ2、TAMRA、MGB或DABCYL中的一种。
4.一种用于检测番茄黄化曲叶病毒的工具,其特征在于,包括权利要求1所述的引物和/或权利要求2-3任一项所述的探针。
5.一种定量检测番茄黄化曲叶病毒的试剂盒,其特征在于,包括权利要求4所述的检测工具。
6.一种非侵入性快速确定植物是否感染番茄黄化曲叶病毒的方法,其特征在于,
使用权利要求1所述的特异性引物和权利要求2或3所述的特异性探针进行检测确认;
或
使用权利要求4所述的用于检测番茄黄化曲叶病毒的工具进行检测确认;
或
使用权利要求5所述的试剂盒进行检测确认。
7.根据权利要求6所述的非侵入性快速确定植物是否感染番茄黄化曲叶病毒的方法,其特征在于,被检测物为从媒介昆虫分泌的蜜露中提取的DNA。
8.根据权利要求7所述的非侵入性快速确定植物是否感染番茄黄化曲叶病毒的方法,其特征在于,所述媒介昆虫为烟粉虱。
9.根据权利要求8所述的非侵入性快速确定植物是否感染番茄黄化曲叶病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)使用沾有缓冲液ASL的棉签收集植物叶片上的烟粉虱蜜露并从蜜露中提取DNA;
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板,加入序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2的引物和序列为SEQ ID NO.3的探针,以及2×ddPCR Super Mix For Probes和RNase free water,配置得到反应体系;
(3)将步骤(2)配制得到的体系和微滴生成油加入微滴发生卡中,置于微滴发生器中生成微滴;
(4)将步骤(3)中生成的微滴转移至ddPCR 96孔板进行扩增反应,反应结束后进行微滴荧光数据分析;
(5)对数据结果进行分析,通过copies/μL计算样品中含有的拷贝数从而得到收集样品是否感染TYLCV,当阳性液滴数大于5个时即可判断样品感染TYLCV。
10.根据权利要求9所述的非侵入性快速确定植物是否感染番茄黄化曲叶病毒的方法,其特征在于,所述的植物包括番茄、辣椒、茄子。
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