[发明专利]一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法在审
申请号: | 202111533253.1 | 申请日: | 2021-12-15 |
公开(公告)号: | CN114317684A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
发明(设计)人: | 于涵洋;李喆;高明媚;王月瑶 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825;C12N15/113 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 曹坤 |
地址: | 210093 江苏省南*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 tna 分子 细胞内 离子 成像 方法 | ||
1.一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,其具体操作步骤如下:
(1)、体外筛选镁离子依赖的具有RNA切割活性的TNA分子;
(2)、对筛选获得的TNA分子序列进行活性测试及截短分析;
(3)、选择其中活性最高的TNA分子进行生物化学表征;
(4)、将TNA分子切割体系构建为镁离子荧光传感器;
(5)、在体外缓冲液中验证该荧光传感器的性能;
(6)、将该传感器转染至细胞中进行体内镁离子的成像。
2.根据权利要求1所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(1)中,所述体外筛选镁离子依赖的具有RNA切割活性的TNA分子具体操作方法是:
首先,合成初始DNA分子随机文库和引物,采用引物延伸的方法获得TNA文库;
然后,通过链霉亲和素分离得到包含RNA底物和TNA分子的单链文库,该文库在含有镁离子的缓冲液中进行孵育,具有切割活性的TNA分子会催化底物发生断裂,使TNA分子从磁珠上被洗脱下来;
最后,被洗脱的TNA分子经过逆转录和PCR扩增后,获得富集的DNA分子文库,应用于下一轮筛选;重复筛选多轮,加大筛选压力,镁离子浓度由20mM降低到1mM,孵育时间由18h降低到1h,以获得高活性的TNA分子。
3.根据权利要求1所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(2)中,所述对筛选获得的TNA分子序列进行活性测试的具体步骤如下:
首先,对筛选结束后富集的DNA分子文库进行测序,并根据测序结果推断于其互补的TNA分子的序列信息;
然后,通过引物延伸反应和链分离制备单链TNA分子;
最后,在反应缓冲液中加入RNA底物和TNA分子,孵育后通过电泳的方式测试其催化活性。
4.根据权利要求1所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(3)中,所述活性最高的TNA分子具体是指:通过截短实验和蛇毒磷酸二酯酶处理后,从而获得的活性最高的TNA分子,其序列如下所示:
5’-GTAGGAGAGGTTATCGTTGGAGGGAGATGAGTGTAG-2’。
5.根据权利要求1所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(4)中,所述构建镁离子荧光传感器具体是:
在RNA底物的5’端和3’端分别标记荧光基团FAM和猝灭基团BHQ-1,当镁离子不存在时,荧光被猝灭;当镁离子存在时,TNA分子催化RNA底物断裂,荧光基团被释放,荧光信号恢复。
6.根据权利要求1所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(5)中,所述在体外缓冲液中验证该荧光传感器的性能具体表现如下:
当镁离子浓度小于20mM时,体系的荧光信号强度与镁离子浓度呈现线性关系,检测限为0.35mM。
7.根据权利要求1所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(6)中,所述将该传感器转染至细胞中进行体内镁离子的成像步骤如下:
首先,利用转染试剂Lipofectamine 3000将荧光传感器转染至细胞内;
然后,利用钙离子载体将培养基中的镁离子运输至细胞内;
最后,细胞孵育后利用共聚焦显微镜进行成像。
8.根据权利要求1和7所述的一种基于TNA分子的细胞内镁离子成像的方法,其特征在于,
在步骤(6)中,所述该传感器体内镁离子的成像的性能表现如下:
该检测方法可在活细胞内对20mM浓度的镁离子进行荧光成像。
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