[发明专利]一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法在审
| 申请号: | 202111522460.7 | 申请日: | 2021-12-13 |
| 公开(公告)号: | CN114107287A | 公开(公告)日: | 2022-03-01 |
| 发明(设计)人: | 张翼冠;赵海洋;魏平 | 申请(专利权)人: | 云测智能科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C40B50/06;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 成都瑞创华盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51270 | 代理人: | 邓瑞;张敏 |
| 地址: | 610000 四川省成都市*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 采用 少量 引物 全面 扩增 humantcr 文库 制备 方法 | ||
1.一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、淋巴细胞裂解和总RNA提取:将样本预处理后,进行RNA提取;
S2、逆转录:对获得的淋巴细胞的总RNA进行逆转录,获得cDNA;
S3、多重PCR:通过对cDNA进行第一轮PCR和第二轮PCR,对cDNA的TCRβ链基因进行特异性扩增;
S4、添加测序接头序列及index;
S5、测序结果分析:高通量测序完成后,使用fastq文件进行数据分析,采用以MIXCR为核心的独特的分析工具将测序结果比对到T细胞受体的V、D、J、C基因参考序列上,利用前一步骤获得的比对结果拼接clonotypes,输出比对结果,最后生成免疫组库多样性图谱。
2.根据权利要求1所述的一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法,其特征在于,根据S1中的操作步骤,包括以下步骤:
S101、取250μL血液转移至1.5mL的RNase-free离心管中,加入750μL裂解液,反复吹打,并剧烈振荡混匀后,室温静置5min;
S102、加入200μL氯仿,剧烈振荡15sec混匀后,制得样品,室温静置2min;
S103、将样品置于离心机中,使混合溶液分层,取上层水相转移至1.5mL的RNase-free离心管中,加入0.5倍体积无水乙醇,颠倒混匀,获得预处理混合液;
S104、将RNA吸附柱套入2mL收集管中,将预处理混合液加入到RNA吸附柱中,离心,弃掉废液;
S105、加入500μL去蛋白液,离心,弃废液;
S106、将RNA吸附柱放回收集管,加入500μL漂洗液,室温离心30sec,弃废液,重复循环一次;
S107、将RNA吸附柱放回收集管,空柱室温离心2min,除去残留的漂洗液;
S108、将RNA吸附柱放入新的1.5mL RNase-free离心管中,RNase-freeH2O洗脱,室温放置2min,然后通过离心1min,收集滤液,即为RNA溶液,然后通过离心1min,收集滤液,即为RNA溶液。
3.根据权利要求2所述的一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法,其特征在于,所述离心机设置温度为4℃,转速为12000rpm,离心10min。
4.根据权利要求1所述的一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法,其特征在于,根据S2中的操作步骤,包括以下步骤:
S201、在RNase-free离心管中配置混合液,将配置的混合液,在温度为65℃的温度下,加热5min,迅速置于冰上骤冷;
S202、配制第一链cDNA合成反应液,用移液器轻轻吹打混匀后,进行第一链cDNA合成反应。
5.根据权利要求4所述的一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法,其特征在于,所述混合液为RNase-freeddH2O、Gene-Specific-Primers和TotalRNA混合制得混合液。
6.根据权利要求4所述的一种采用少量简并引物全面扩增humanTCRβ链文库的制备方法,其特征在于,所述第一链cDNA合成反应液为混合液、2×RTMix和EnzymeMix混合制得。
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