[发明专利]一种用于黑色茶花杂种鉴定的SSR标记引物及应用有效
申请号: | 202111503455.1 | 申请日: | 2021-12-09 |
公开(公告)号: | CN114150083B | 公开(公告)日: | 2022-07-26 |
发明(设计)人: | 李辛雷;张莹;范梦龙 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆晶智汇知识产权代理事务所(普通合伙) 50229 | 代理人: | 李靖 |
地址: | 311400 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 黑色 茶花 杂种 鉴定 ssr 标记 引物 应用 | ||
一种用于黑色茶花杂种鉴定的SSR标记引物,所述引物为引物编号:SSR31,上游引物:5′‑CAAGGCAGAGTAGGCTGAGG‑3′,下游引物:5′‑AAAAGGGAAGGGGAAAGTCA‑3′,重复单元:(AGC)7,片段大小:212~273;引物编号:SSR48,上游引物:5′‑GTTGGAGGTTTTTCAGCCAC‑3′,下游引物:5′‑ATTGAAAGTCGCTGCTTCGT‑3′,重复单元:(CCG)7,片段大小:249~300;引物编号:SSR250,上游引物:5′‑ACCTCCAGCTTCCATCAGAA‑3′,下游引物:5′‑ATCTTGACGGGCGTAACATC‑3′,重复单元:(CCG)5,片段大小:261~315。本发明SSR标记重复性好、特异性强;利用SSR分子标记技术对黑色茶花杂种进行了有效鉴定,明确了黑色茶花杂种与亲本遗传变异的关系,实现对黑色茶花杂种后代进行快速鉴定和早期选择。
技术领域
本发明属于茶花杂种鉴定技术领域,具体涉及一种用于茶花杂种鉴定的SSR标记引物及应用。
背景技术
茶花(Camellia)是我国十大名花,也是世界名贵花卉之一。尽管目前国际茶花协会登陆的品种有20000多个,但市场上常见的茶花品种花色主要为红色、粉色及白色,少量品种为黄色,而具有极高观赏价值及开发利用前景的黑色茶花品种仅10余个,且大多为国外选育。黑色茶花品种花瓣呈现黑红色,鲜艳活泼,有蜡质感,满足人们对特异新奇花卉品种的追求;同时黑色茶花花青苷含量丰富,而花青素具有抗氧化衰老的作用,因此,黑色茶花具有良好的商品市场优势及开发利用前景。SSR技术广泛用于分子遗传标记种质资源鉴定等方面,目前SSR分子标记技术用于黑色茶花杂种鉴定还未见报道。
发明内容
本发明目的在于提供一种用于黑色茶花杂种鉴定的SSR标记引物,该引物重复性好、特异性强。
本发明目的按如下技术方案实现:
一种用于黑色茶花杂种鉴定的SSR标记引物,所述引物为(如SEQ ID NO.1~6所示):
引物编号:SSR31,上游引物:5′- CAAGGCAGAGTAGGCTGAGG -3′,下游引物:5′-AAAAGGGAAGGGGAAAGTCA -3′,重复单元:(AGC)7,片段大小:212~273;
引物编号:SSR48,上游引物:5′- GTTGGAGGTTTTTCAGCCAC -3′,下游引物:5′-ATTGAAAGTCGCTGCTTCGT -3′,重复单元:(CCG)7,片段大小:249~300;
引物编号:SSR250,上游引物:5′- ACCTCCAGCTTCCATCAGAA -3′,下游引物:5′-ATCTTGACGGGCGTAACATC -3′,重复单元:(CCG)5,片段大小:261~315;
鉴定黑色茶花杂种的方法,具体步骤如下:
步骤1,DNA提取: 将黑色茶花杂种及其亲本叶片加液氮研磨后提取DNA,分光光度计检测DNA浓度和纯度,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量;
步骤2,SSR扩增:利用本发明SSR引物,以黑色茶花杂种及其杂交亲本DNA为模板进行SSR扩增;
步骤3,对扩增产物采用Qsep100全自动核酸蛋白分析系统进行电泳分离检测和片段大小测定。步骤4,对电泳结果分析:对SSR检测结果进行峰图分析及等位基因的读取和分析,根据峰值图,检测到黑色茶花杂种具有母本及父本扩增谱带,尤其具有父本特异扩增谱带,据此判断其为真杂种。
具体地,步骤1中提取DNA是按北京艾德莱生物科技有限公司CTAB植物基因组DNA快速提取试剂盒的提取方法提取;采用分光光度计(美国Thermo 公司)检测DNA浓度和纯度。
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