[发明专利]一种用于黑色茶花杂种鉴定的SSR标记引物及应用有效
申请号: | 202111503455.1 | 申请日: | 2021-12-09 |
公开(公告)号: | CN114150083B | 公开(公告)日: | 2022-07-26 |
发明(设计)人: | 李辛雷;张莹;范梦龙 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆晶智汇知识产权代理事务所(普通合伙) 50229 | 代理人: | 李靖 |
地址: | 311400 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 黑色 茶花 杂种 鉴定 ssr 标记 引物 应用 | ||
1.SSR标记引物在鉴定黑色茶花杂种中的应用,所述引物为:
引物编号:SSR31,上游引物:5′- CAAGGCAGAGTAGGCTGAGG -3′,下游引物:5′-AAAAGGGAAGGGGAAAGTCA -3′,重复单元:(AGC)7,片段大小:212~273;
引物编号:SSR48,上游引物:5′- GTTGGAGGTTTTTCAGCCAC -3′,下游引物:5′-ATTGAAAGTCGCTGCTTCGT -3′,重复单元:(CCG)7,片段大小:249~300;或
引物编号:SSR250,上游引物:5′- ACCTCCAGCTTCCATCAGAA -3′,下游引物:5′-ATCTTGACGGGCGTAACATC -3′,重复单元:(CCG)5,片段大小:261~315。
2.采用权利要求1所述的引物鉴定黑色茶花杂种的方法,其特征在于,具体步骤如下:
步骤1,DNA提取: 将黑色茶花杂种及其亲本叶片加液氮研磨后提取DNA,分光光度计检测DNA浓度和纯度,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量;
步骤2,SSR扩增:利用所述的引物,以黑色茶花杂种及其杂交亲本DNA为模板进行SSR扩增;
步骤3,对扩增产物采用Qsep100全自动核酸蛋白分析系统进行电泳分离检测和片段大小测定;
步骤4,对电泳结果分析:对SSR检测结果进行峰图分析及等位基因的读取和分析,根据峰值图,检测到黑色茶花杂种具有母本及父本扩增谱带,据此判断其为真杂种。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于:步骤1中提取DNA是按北京艾德莱生物科技有限公司CTAB植物基因组DNA快速提取试剂盒的提取方法提取。
4.如权利要求2或3所述的方法,其特征在于:步骤2中SSR扩增反应在Veriti 96-WellThermal Cycler上进行,步骤2中25 μL反应体系:含100 ng的模板DNA 1.5 μL,2×TSINGKEMaster Mix 12.5 μL,10 mmol•L-1引物2 μL,超纯水9 μ;PCR扩增程序:94 ℃预变性5min;94 ℃变性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,35个循环;72 ℃延伸9 min。
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