[发明专利]基于DNA三链介导构建多维DNA酶矩阵的超灵敏循环核酸检测体系、试剂盒和方法有效
申请号: | 202111503274.9 | 申请日: | 2021-12-10 |
公开(公告)号: | CN114107510B | 公开(公告)日: | 2023-10-03 |
发明(设计)人: | 张何;张培柔;马思元;傅昕 | 申请(专利权)人: | 湖南工程学院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6825;C12Q1/682;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 苏士莹 |
地址: | 411100 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 dna 三链介导 构建 多维 矩阵 灵敏 循环 核酸 检测 体系 试剂盒 方法 | ||
1.一种基于三链DNA构建分子间裂分式G-四链体-血红素DNA酶矩阵的传感体系,其特征在于,所述传感体系包括6条寡核苷酸探针:捕获探针Capture、H1、H2、L3、L1和L2;
其中捕获探针Capture、H1、H2和L3均包含茎环发夹结构,且在每个所述茎环发夹结构中还包括引发信号放大的DNA序列,每个所述茎环发夹结构不发生杂交反应;
L1探针的核苷酸序列中包含15个碱基的相同嘧啶和一组GGG序列;
L2探针的核苷酸序列中包含15个碱基的相同嘧啶和三组GGG序列。
2.根据权利要求1所述的传感体系,其特征在于,所述捕获探针Capture的茎部为13个碱基、环部为11个碱基和单链末端为9个碱基;
H1和H2的茎部均为18个碱基、环部均为6个碱基和单链末端均为6个碱基;
L3的茎部为12个碱基、环部为4个碱基和单链末端为10个碱基。
3.权利要求1或2所述的传感体系在制备循环核酸检测试剂盒中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述循环核酸包括循环肿瘤DNA。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,当所述循环肿瘤DNA为乳腺癌ctDNA时,所述捕获探针Capture的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述H1的核苷酸序列如SEQ IDNO.3所示,所述H2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述L3的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,所述L1的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,所述L2的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述乳腺癌ctDNA的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。
7.一种检测乳腺癌ctDNA的试剂盒,其特征在于,包括捕获探针Capture、H1、H2、L3、L1和L2,其中所述捕获探针Capture的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述H1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述H2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述L3的核苷酸序列如SEQID NO.5所示,所述L1的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,所述L2的核苷酸序列如SEQ IDNO.7所示。
8.一种非诊疗目的的基于权利要求7所述试剂盒检测乳腺癌ctDNA的方法,包括以下步骤:(1)分别将所述捕获探针capture、H1、H2和L3加热到90℃孵育10min,梯度退火到25℃,分别得具有发夹结构的捕获探针capture、H1、H2和L3;
(2)将步骤(1)得到的所述具有发夹结构的捕获探针capture、H1、H2和L3与样本提取的ctDNA和Tris-Ac buffer混合成检测体系,37℃下孵育3h,而后30℃孵育4h,得孵育液;
(3)将步骤(2)所述孵育液与L1、L2、Tris-Ac buffer和hemin混匀,25℃下孵化1h,得反应液;
(4)将步骤(3)所述反应液与ABTS2-和H2O2混合均匀后,25℃孵育8min,进行比色,当有绿色产生时表明所述样本中包含乳腺癌ctDNA。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述检测体系以20μL计,包括:0.4μL ctDNA、1.2μL捕获探针Capture、1.2μL H1、1.2μL H2、0.8μL L3和15.2μL Tris-Acbuffer。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(3)所述孵育液与L1、L2、Tris-Acbuffer和hemin的体积比为20:6:6:16:2。
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