[发明专利]基于多重荧光定量ARMS-PCR技术的新冠病毒奥密克戎突变序列检测技术及其应用在审

专利信息
申请号: 202111497771.2 申请日: 2021-12-09
公开(公告)号: CN113943838A 公开(公告)日: 2022-01-18
发明(设计)人: 孔祥宾;李万帅;汤丽丽 申请(专利权)人: 常州国药医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 常州市权航专利代理有限公司 32280 代理人: 黄晶晶
地址: 213000 江苏省常*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 多重 荧光 定量 arms pcr 技术 病毒 奥密克戎 突变 序列 检测 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于检测新冠病毒核酸S基因突变类型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括以下任一种或几种引物和探针,其中每组中的引物都包含正向引物和反向引物,每个所述探针的两端分别标记有荧光报告基团/荧光淬灭基团:

a.用于检测S基因突变类型:序列位置23599,序列变化TG的引物和探针;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.1所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,其中探针的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;

b.用于检测S基因突变类型:序列位置23048,序列变化GA的引物和探针;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.4所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,其中探针的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示;

c.用于检测S基因突变类型:序列位置23202,序列变化CA的引物和探针;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.7所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示,其中探针的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示;

d.用于检测S基因突变类型:序列位置22898,序列变化GA的引物和探针;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.10所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.11所示,其中探针的核苷酸序列如SEQ ID No.12所示。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述荧光报告基团/荧光淬灭基团选自选自FAM、VIC或HEX、ROX、NED、CY3或CY5荧光报告基团/MGB或非MGB的BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcy1、Tamra和Quencher荧光淬灭基团且试剂盒中各个所述探针上荧光报告基团互不相同。

3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括以下组分中的任一种或几种:PCR反应液、酶混合液、阳性对照、阴性对照。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液包括缓冲液、MgCl2、dUTP和dNTPs;所述酶混合液包括Taq酶、反转录酶和UNG酶。

5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照为含有新冠病毒突变序列的假病毒。

6.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述阴性对照为含有部分新冠病毒的基因序列的假病毒。

7.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于检测内标的探针。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述探针包括核苷酸序列如SEQ IDNo.13、SEQ ID No.14、SEQ ID No.15所示的多核苷酸中的任一种或几种。

9.如权利要求1-8任一项所述试剂盒用于检测以下任一种或几种新冠病毒核酸S基因突变类型中的用途:a,S基因突变类型:序列位置23599,序列变化TG;b.S基因突变类型:序列位置23048,序列变化GA;c.S基因突变类型:列位置23202,序列变化CA;d.S基因突变类型:序列位置22898,序列变化GA。

10.如权利要求1-8任一项所述试剂盒在制备检测以下任一种或几种新冠病毒核酸S基因突变类型的产品中的用途:a.S基因突变类型:序列位置23599,序列变化TG;b.S基因突变类型:序列位置23048,序列变化GA;c.S基因突变类型:序列位置23202,序列变化CA;d.S基因突变类型:序列位置22898,序列变化GA。

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