[发明专利]一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法在审
申请号: | 202111487621.3 | 申请日: | 2021-12-08 |
公开(公告)号: | CN114354778A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 杨霜;李佳佳 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/12;G01N30/86 |
代理公司: | 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 陆金星 |
地址: | 215137 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 富集 结合 糖肽 切分 tn 抗原 方法 | ||
本发明公开了一种基于固相富集结合O‑糖肽酶切分析Tn抗原的方法,包括步骤:蛋白提取和浓度测量;蛋白酶解;多肽纯化;固相结合;唾液酸处理;N聚糖切除;OpeRATOR酶切;O‑Glycoprotease酶切;LC‑MS分析。该方法能够在固相上耦合糖肽,使用两种O‑糖肽酶切O‑糖肽来鉴定Tn抗原的O‑糖基化位点和Tn抗原的表达量,用作癌症诊断的生物标志物。
技术领域
本发明属于生物分子分析试剂技术领域,具体涉及固相偶联糖肽和采用O-糖肽酶切富集Tn抗原的分析方法。
背景技术
Tn抗原(O-GalNAc)是一种与肿瘤相关的碳水化合物,在大多数癌组织表面高表达。它的分子量小、结构简单、通常表达在细胞表面,可被免疫系统识别为外来物。因此,检测Tn抗原的表达不仅反映免疫抑制微环境的情况,并且可作为癌症的诊断标志物-特别是早期阶段的特征,也可显示肿瘤的进展以及预后状况。目前对于Tn抗原的检测手段主要有单克隆抗体、凝集素富集以及点击化学等。这些方法大多缺乏特异性和灵敏度,易造成结果的假阳性和假阴性率,且步骤繁琐、成本高。点击化学的催化效率低且重现性差。无铜点击化学生物素方法,所用试剂较为昂贵且叠氮化物剧毒、易爆炸。目前缺乏一种高效便捷的方法能够检测Tn抗原的表达及鉴定其在标志物中的特异性位点。
因此,有必要研发一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法来解决现有技术中鉴定Tn抗原糖蛋白标志物的问题。
发明内容
本发明目的是提供一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法。
本发明的一种技术方案是:
一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,包括步骤:
1)蛋白提取和浓度测量;
2)蛋白酶解;
3)多肽纯化;
4)固相结合;
5)唾液酸处理;
6)N聚糖切除;
7)OpeRATOR酶切;
8)O-Glycoprotease酶切;
9)LC-MS分析。
进一步的,在步骤1)中,所述蛋白提取和浓度测量包括:在细胞中依次加入RIPA裂解液、蛋白酶抑制剂和EDTA后,使用超声破碎仪破碎,冷却,重复操作直至样本溶液澄清,离心,取上层清液并用1×Tris稀释,使用Pierce BCA蛋白定量分析试剂盒测试蛋白的浓度。
进一步的,在步骤2)中,所述蛋白酶解包括步骤:
(1)根据测定的蛋白的浓度,从上层清液中取蛋白,使得所述蛋白的总量在400-600ug,溶于尿素,轻微振荡,直至蛋白完全溶解,获得样品溶液;
(2)向所述样品溶液中加入总体积1/10的TCEP,孵育;
(3)向所述样品溶液中加入总体积1/10的IAA,置于暗箱中孵育;
(4)向所述样品溶液中加入HPLC水,使得所述样品溶液中尿素的浓度<1.6M,调节所述样品溶液的pH至7-9;
(5)向所述样品溶液中加入胰蛋白酶,使得所述样品溶液的蛋白量与所述胰蛋白酶的体积比为50:1~40:1,孵育过夜。
进一步的,在步骤3)中,所述多肽纯化包括步骤:
(1)向所述样品溶液中加入甲酸,使所述样品溶液的pH<3;
(2)将所述样品溶液加入预先处理的C18萃取柱中,重复操作;
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